1976年南大在校師生率先發(fā)起旨在反對和結(jié)束文化大革命的南京三·二九事件”為四五運動的先聲南京反文革勢力運動影響全國。

1978年5月哲學系青年教師胡福明發(fā)表了《實踐是檢驗真理的唯一標準》引發(fā)全國真理標準問題大討論拉開了當代中國思想解放的序幕推動了鄧小平領(lǐng)導(dǎo)開創(chuàng)的中國改革開放時代的到來。

1978年5月匡亞明復(fù)任校長1984年8月曲欽岳任校長。

1993年南京大學浦口校區(qū)投入使用2009年成為金陵學院校園。

1994年南京大學被確定為國家“211工程”重點支持的大學。

1999年南京大學進入國家“985工程”首批重點建設(shè)的高水平大學行列。

2006年教育部和江蘇省再次簽訂重點共建南京大學的協(xié)議。

2009年10月南京大學仙林校區(qū)啟用。仙林校區(qū)按規(guī)劃和鼓樓校區(qū)協(xié)作分工成為南京大學主校區(qū)。

2009年12月30日南京大學在原有的物理學系、電子科學與工程系和材料科學與工程系的基礎(chǔ)上新組建成立了物理學院、電子科學與工程學院、現(xiàn)代工程與應(yīng)用科學學院實現(xiàn)文理工醫(yī)四大學科領(lǐng)域協(xié)調(diào)發(fā)展。

2011年教育部和江蘇省簽署協(xié)議繼續(xù)重點共建南京大學。

2016年，南京大學入選首批國家級雙創(chuàng)示范基地。

2017年，南京大學入選A類世界一流大學建設(shè)高校名單，15個學科入選世界一流學科建設(shè)名單。

2018年1月22日，由江蘇省作家協(xié)會和南京大學合作共建的江蘇文學院在南大仙林校區(qū)掛牌成立。

2018年3月6日，南京大學正式成立人工智能學院。