推薦一款免費(fèi)、好用的在線基因ID轉(zhuǎn)換工具
做生信的小伙伴經(jīng)常有卡在基因 ID轉(zhuǎn)換，R語言編程又不熟悉，弄得頭暈?zāi)X脹。今天為大家推薦一款免費(fèi)、好用的在線基因 ID轉(zhuǎn)換工具：Biogeneid。
工具網(wǎng)址：http://biogeneid.info/
一、頁面展示
Biogengid是一個(gè)基于網(wǎng)頁的在線基因 ID轉(zhuǎn)換工具，進(jìn)入Biogengid主頁后，如下圖所示：
二、輸入格式
注冊后實(shí)測發(fā)現(xiàn)，主要有以下優(yōu)點(diǎn)
? ?支持批量ID轉(zhuǎn)換，用戶圖形界面簡潔易懂
? 強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫收錄，支持44種基因ID間的轉(zhuǎn)換
? 智能的兼容性混合輸入，不同物種和不同基因ID類型的基因ID可以混合作為批量輸入
? 轉(zhuǎn)換速度快，結(jié)果導(dǎo)出方便
? ? ?Biogeneid支持44種基因ID之間的轉(zhuǎn)換，只要你的輸入是其中一種或者多種組成即可?；騃D間以，隔開作為輸入，點(diǎn)擊搜索即可轉(zhuǎn)換。
? ? ?仔細(xì)查了一下，發(fā)現(xiàn)支持下面44種基因ID
transcriptview：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的在轉(zhuǎn)錄視圖下的注釋項(xiàng)
locusview：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的在locus視圖下的注釋項(xiàng)
gintegra：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的在基因組視圖下的注釋項(xiàng)
ppiview：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的蛋白質(zhì)相互作用注釋項(xiàng)
nucleotide：美國國立衛(wèi)生研究院NCBI的nucleotide數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)，又稱Gene RefSeq
genbank：美國國立衛(wèi)生研究院NCBI的genebank數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)
entrezgene：美國國立衛(wèi)生研究院NCBI的Gene數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)，又稱Gene_ID
omim：約翰霍普金斯大學(xué)的OMIM數(shù)據(jù)庫提供的遺傳表型注釋項(xiàng)
pubmed：NCBI的pubmed數(shù)據(jù)庫提供的文獻(xiàn)注釋項(xiàng)
gemdbj：日本的GEMDBJ數(shù)據(jù)庫提供的醫(yī)學(xué)相關(guān)注釋項(xiàng)
Hugo：人類基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)
mutationview：HGV數(shù)據(jù)庫提供的人類基因組變異注釋項(xiàng)
hgold：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的基因多樣性注釋項(xiàng)
pdbj：日本蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫提供的結(jié)構(gòu)注釋項(xiàng)
uniprot：歐洲生物信息學(xué)中心EMBL-EBI的UNIPROT數(shù)據(jù)庫提供的蛋白注釋項(xiàng)
ggdb
frnadb：fRNAdb數(shù)據(jù)庫提供的RNA注釋項(xiàng)
enst：ensmbl數(shù)據(jù)庫提供的轉(zhuǎn)錄組注釋項(xiàng)
ensg：ensmbl數(shù)據(jù)庫提供的基因注釋項(xiàng)
ensp：ensmbl數(shù)據(jù)庫提供的蛋白注釋項(xiàng)
nbrc：日本生物資源中心提供的注釋項(xiàng)
hgpd：人類基因與蛋白數(shù)據(jù)庫HGPD提供的注釋項(xiàng)
kegg：京都基因與基因組百科全書KEGG數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)
pathway：京都基因與基因組百科全書KEGG數(shù)據(jù)庫提供的通路視圖注釋項(xiàng)
hprd：人類蛋白參考數(shù)據(jù)庫HPRD提供的注釋項(xiàng)
legenda：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的疾病注釋項(xiàng)
evola：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的人類基因進(jìn)化注釋項(xiàng)
hdbas：人類選擇性剪接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫HDBAS提供的注釋項(xiàng)
gcompass：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的比較基因組學(xué)視圖下的注釋項(xiàng)
proteinview：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的蛋白視圖下的注釋項(xiàng)
cipro：美國食品藥品監(jiān)督局FDA藥品數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)
hangel：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的人類基因在不同平臺(tái)與成人組織中的表達(dá)譜注釋項(xiàng)
fljh：fljh數(shù)據(jù)庫提供的cDNA-locus注釋項(xiàng)
varysysdb：H-InvDB數(shù)據(jù)庫提供的人類基因單核苷酸多態(tài)性等基因組變異注釋項(xiàng)
pdbechem：歐洲生物信息學(xué)中心EMBL-EBI提供的蛋白結(jié)構(gòu)與化學(xué)組分注釋項(xiàng)
drugbank_h：DRUGBANK數(shù)據(jù)庫提供的藥物信息注釋項(xiàng)
wikipedia_hp：維基百科注釋項(xiàng)
protein：美國國立衛(wèi)生研究院NCBI的protein數(shù)據(jù)庫提供的注釋項(xiàng)，又稱Protein RefSeq
dgv：DGV數(shù)據(jù)庫提供的人類基因組結(jié)構(gòu)變異注釋項(xiàng)
coxpres：COXPRES數(shù)據(jù)庫提供的基因調(diào)控注釋項(xiàng)
atlas：人類蛋白圖譜數(shù)據(jù)庫提供的蛋白質(zhì)譜等信息的注釋項(xiàng)
peptide：多肽圖譜數(shù)據(jù)庫提供的多肽質(zhì)譜注釋項(xiàng)
nextprot：瑞士生物信息研究所的NEXTPROT數(shù)據(jù)庫提供的蛋白質(zhì)相關(guān)注釋項(xiàng)
disgenet：DisGeNET數(shù)據(jù)庫提供的人類基因突變與表型相關(guān)注釋項(xiàng)
三、輸出格式
以批量轉(zhuǎn)換為例，取了999條基因ID進(jìn)行批量轉(zhuǎn)換，輸出格式如下圖所示。
