鑒別樣本中微生物種類并定義微生物群落內(nèi)關(guān)系，在人類健康、環(huán)境調(diào)查、動(dòng)物保護(hù)和農(nóng)業(yè)改良等方面均有重要的應(yīng)用。 ?16S rRNA 測(cè)序，經(jīng)常用于鑒定和分析樣本的微生物群落組成。?

myBaits Expert 16S-Hyb Panel?運(yùn)用雜交捕獲技術(shù)，可以富集整個(gè) 16S 基因，而不僅僅是一兩個(gè)高變區(qū)（hypervariable ?regions）。與 16S 擴(kuò)增子測(cè)序相比，具有更好的分類分辨率和更少的偏差。此試劑盒結(jié)合宏基因組方法，還可以有效鑒 別全新表型的稀有微生物，并降低單個(gè)樣本的測(cè)序深度。將 16S-Hyb rRNA 基因富集測(cè)序與低覆蓋度鳥(niǎo)槍法測(cè)序相結(jié)合， 可以更高效地鑒別宏基因組樣本中的微生物種群，比單獨(dú)的鳥(niǎo)槍法測(cè)序成本低，并且比 16S 擴(kuò)增子測(cè)序更準(zhǔn)確。

myBaits Expert 16S-Hyb Panel?為完整試劑盒，包含各種blockers 、雜交探針和驗(yàn)證過(guò)的操作流程。此外，我們也提供全流程的技術(shù)服務(wù)。

特點(diǎn)?

快捷 – 可直接使用鳥(niǎo)槍法的 NGS 文庫(kù)進(jìn)行捕獲測(cè)序

低成本 – 可用較少的測(cè)序量鑒別宏基因組樣本中的稀有類群?

低偏差 – 有效避免 16S 擴(kuò)增子測(cè)序引入的擴(kuò)增偏差?

高分辨率 – 檢測(cè)全部保守和高變區(qū)域?

開(kāi)放平臺(tái) – 與各種 NGS 文庫(kù)平臺(tái)兼容，包括長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序?

組分齊全 – 試劑盒包括 NGS 文庫(kù)捕獲所需的所有試劑?

應(yīng)用?

? 宏基因組學(xué)?

? 環(huán)境采樣?

? 古 DNA?

? 微生物組分析?

? 長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序

與擴(kuò)增子測(cè)序法相比，16S-Hyb 準(zhǔn)確性更高

在人造模擬群落、?鼠糞便和?鼠結(jié)腸的樣本中，比較 myBaits 16S 捕獲測(cè)序、16S 擴(kuò)增?測(cè)序和?槍法宏基因組測(cè)序法。未經(jīng)富集的宏基因組測(cè)序（鳥(niǎo)槍法）收集到的數(shù)據(jù)，16S 約占總數(shù)據(jù)量的 0.1-0.2%；與之相 比，myBaits 16S-Hyb 捕獲測(cè)序中，60-70% reads 可以比對(duì)到 16S 區(qū)域，在模擬群落樣本中富集了 350 ?倍，?鼠糞便和?鼠結(jié)腸樣本中富集了 450 倍。myBaits 16S-Hyb 捕獲測(cè)序與擴(kuò)增子測(cè)序法相比，無(wú)論用 ?MiSeq 或 HiSeq 測(cè)序，樣本富集圖譜更接近于模擬群落組成和鳥(niǎo)槍法圖譜。

圖1 模擬樣本類群分析

樣本“BEI Resources 模擬群落"包含已知含量的細(xì)菌群（第5列），分別使?16S擴(kuò)增?測(cè)序- MiSeq PE 300（第1列）、myBaits 16S-HybMiSeq PE 300（第2列）、myBaits 16S-Hyb-HiSeq PE 150（第3列）和?槍法宏基因組測(cè)序-HiSeq PE 150（第4列）。?雜交捕獲和shotgun測(cè)序的 reads 過(guò)濾后，使? bbmap 比對(duì)到GreenGenes?數(shù)據(jù)庫(kù)分析。擴(kuò)增子測(cè)序的 reads 用 Dada2 pipeline 處理后比對(duì)到GreenGenes 數(shù)據(jù)庫(kù)。

圖2. 16S 擴(kuò)增子測(cè)序 vs 16S Hyb vs 鳥(niǎo)槍法?

從?鼠糞便和?鼠結(jié)腸中提取的DNA樣本，分別使用 16S 擴(kuò)增?測(cè)序- ?MiSeq PE 300（第1,5 列），myBaits 16S-Hyb- MiSeq PE 300（第?2,6列），myBaits 16S-Hyb-HiSeq PE 150（第3,7列）和?槍法宏基因組測(cè)序-HiSeq PE 150（第 4,8 列）進(jìn)行分析。?雜交捕獲和shotgun法測(cè)序的 reads 過(guò)濾后，使? bbmap 比對(duì)到 GreenGenes數(shù)據(jù)庫(kù)分析。擴(kuò)增子測(cè)序的 reads 用 Dada2 pipeline 處理后比對(duì)到 ?GreenGenes 數(shù)據(jù)庫(kù)。