scATAC-seq分析主要軟件

雖然單細(xì)胞表觀組學(xué)如scATAC技術(shù)已經(jīng)十分成熟,但并沒有像單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組一樣分析方法那么多,討論的也不多。

通過(guò)資料整理,目前常用的scATAC技術(shù)分析軟件為AchR、Signac、Snap,這三個(gè)軟件我都有下載并學(xué)習(xí)使用,最終發(fā)現(xiàn)AchR是最好用的,能做的分析最多,學(xué)習(xí)過(guò)程最為流暢;

我本想嘗試使用Signac也進(jìn)行分析,但總是很多bug出現(xiàn),最終雖然能通過(guò)再github上找答案,但這個(gè)軟件還在不斷的優(yōu)化過(guò)程中。因此推薦大家用AchR.

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