寫在前面
Emmm，無意間看到的一個(gè)工具。從某種意義上來說，類似真核生物中的基因家族分析自動(dòng)化工具。當(dāng)然，差別還是有不少的。雖然我?guī)缀醪蛔鲈松锵嚓P(guān)課題，不過這個(gè)工具相信對(duì)一些做數(shù)據(jù)分析的朋友有一定的幫助 。
TREDN 簡(jiǎn)介
直接上圖，更為清晰。
用戶只需要上傳一堆蛋白序列或者ID，更或者多序列比對(duì)結(jié)果，然后啥事情都不用干。這個(gè)網(wǎng)頁工具會(huì)給你：
- 構(gòu)建進(jìn)化樹
- 預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)域
- 整理輸入基因的側(cè)翼基因
-
直接出圖【這是重點(diǎn)關(guān)鍵】
比如
或者
感覺不錯(cuò)，雖然只是原核生物。
寫在后面
Hmmm... 文章的題目挺好，內(nèi)容也還可以。我大體過了一遍，覺得這個(gè)工作的完成難度其實(shí)不高，不過應(yīng)該確實(shí)可以減少不少工作量。
當(dāng)然，其中比較讓我感興趣的還是側(cè)翼基因的挖掘。從文章來看，似乎只是抓已有注釋的側(cè)翼序列。具體沒有查看源碼，無從得知。
Anyway，相信做原核生物的朋友會(huì)感興趣。
