小組學(xué)習(xí)DAY6-ZZW

內(nèi)容來(lái)自生信星球

R包與小抄

安裝R包

  • install.packages("R包")
  • 直到出現(xiàn)<，表示安裝成功
    可能出現(xiàn)的問(wèn)題：
    1.換一個(gè)鏡像

    方法

加載R包

  • library(R包)

關(guān)于數(shù)據(jù)框

1.新建數(shù)據(jù)框
a<-data.frame(GeneId = rep("gene5",times=3),SampleName =paste("Sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

  • rep，重復(fù)，括號(hào)中填要重復(fù)的字符和重復(fù)次數(shù)。
  • paste，連接兩個(gè)字符串，括號(hào)要填兩個(gè)代連接字符并指定分隔符（sep），沒(méi)有分隔符就填sep=“”。
  • 1：3表示從1到三。如需一列中需要填入三個(gè)無(wú)規(guī)律的數(shù)字，可以用向量c(1，3，4)，同樣如果填的是字符串也需要加雙引號(hào)，例如c("doudou","huahua","xiaoyu")。
  • 了解概念：key-value--“鍵值對(duì)” ，表示一種對(duì)應(yīng)關(guān)系?！版I”和“值”都是列名，如SampleName和Expression的對(duì)應(yīng)
    括號(hào)里是“列名”=列值，這里列名要加雙引號(hào)
    得到的數(shù)據(jù)框

    實(shí)際操作

tidydata

  • 一種組織表格數(shù)據(jù)的方式
  • 提供了一種能夠跨包使用的“統(tǒng)一”的數(shù)據(jù)格式

  • 什么叫“統(tǒng)一”？
    每個(gè)變量（variable）占一列，每個(gè)情況（case）和觀測(cè)值（observation）占一行


    處理前

    處理后

    1.Reshape Data
    2.Handle Missing Values

  1. Expand Tables

思維導(dǎo)圖


R包使用.png
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