10x Genomics發(fā)布空間Visium HD平臺,在更高分辨率下卷起來

空間組學(Spatial Omics)技術在2022年被《Nature》雜志列為最值得關注的七大技術之一,被譽為“生命科學”的下一個風口。之前小編剛介紹了市場上較成熟的空間組學產(chǎn)品,其中包括10x Genomics的Visium平臺。近期摩根大通(JP Morgan)會議上,10x Genomics又發(fā)布了升級版本Visium HD。

10x Genomics公司首席執(zhí)行官Serge Saxonov在本周于摩根大通(JP Morgan)舉行的醫(yī)療保健會議上重點介紹了公司的產(chǎn)品開發(fā)路線圖,并詳細介紹了公司產(chǎn)品組合即將取得的進展。在發(fā)言的最后,他宣布推出新的Visium HD系統(tǒng),將現(xiàn)有Visium平臺的分辨率從55微米光斑提高到2x2微米正方形,從而實現(xiàn)單細胞水平的分析。新系統(tǒng)現(xiàn)已開始接受訂購,旨在滿足客戶對更高分辨率Visium產(chǎn)品的需求。

10x Genomics宣布他們已經(jīng)出貨了500臺Visium CytAssist儀器,這為除了Xenium之外的Visium HD奠定了基礎。

Visium HD: 2平方微米,比Visium v1密度大得多。

現(xiàn)有的10x Visium空間轉錄組捕獲區(qū)域6.5x6.5mm、spot數(shù)量約5000個、spot直徑 55μm、分辨率100μm、支持HE染色。而新發(fā)布的Visium HD平臺將直徑 55μm直徑的圓形區(qū)域改成了2x2μm的正方形,數(shù)目也從5千個spot大幅提升到1100萬個squares,并且正方形之間沒有缺少探針的真空地帶,實現(xiàn)了NO GAPs。

可以直觀地看到其中的區(qū)別
已經(jīng)對大量樣本進行了測試。

從圖中我們可以直觀的看到升級后的Visium HD的數(shù)據(jù),不再是一個個圓點組成的區(qū)域,而是更為密集且充滿整個組織區(qū)域的表達圖譜,這將解決10x Genomics平臺一直被詬病的分辨率不足的問題,真正可以達到單個細胞的分辨率。

Visium HD的實驗流程。

Visium HD將在24年一季度發(fā)貨,對于已經(jīng)擁有CytAssist的人來說,他們只需要預訂芯片和相關套件進行升級。

10x Genomics的三大產(chǎn)品線。

10x Genomics也展示了他們總體的產(chǎn)品策略:繼續(xù)用更高的分辨率和更高的通量來淘汰舊的遺留技術。單細胞轉錄組(Chromium平臺)現(xiàn)在可以實現(xiàn)每個細胞數(shù)千個轉錄本的捕獲測序,這是下一代測序技術(Next-generation sequencing)在細胞分辨率上的更進一步。另一個是原位技術(Xenium平臺)可以在高分辨率下完成大型圖像繪制。

用更高的分辨率和更高的通量來淘汰舊的遺留技術。

現(xiàn)在10x Genomics的第三個支柱是Visium HD,它實現(xiàn)了在空間轉錄組水平的第三條產(chǎn)品線。10x Genomics強調產(chǎn)品的互補性,輔以軟件集成,它允許研究人員在所有3個平臺上無縫地觀察給定樣本的可比數(shù)據(jù)點。

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