清明節(jié)了，放假期間好好放松一下自己，但是我仍然記得大學老師說過的一句話，放假休息的同時，總結(jié)過去，展望以后，所以說假期是一個承前啟后的時間段，今天我們不講新的東西，而是回顧一下單細胞軌跡分析的一些內(nèi)容。
第一部分，降維，
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第一頁其實在說明為什么我們數(shù)據(jù)分析的時候為什么先要用PCA降維，PCA降維到50-100維
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這一頁講了tSNE降維的原理和PCA的連用。那么第一個問題就來了，為什么我們要先PCA降維后再使用tSNE降維呢？看了PPT相信大家都有答案了吧
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第三頁關(guān)于UMAP降維，現(xiàn)在明白為什么UMAP降維后的結(jié)果cluster之間的距離為什么變得遠了吧。
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第四頁，PHATE降維，優(yōu)劣勢一目了然。
第二部分，軌跡分析
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我們常見的軌跡類型。
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分析的一般過程
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發(fā)育基因的選擇及優(yōu)缺點
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可視化的方法，知道都是什么軟件做出來的么？？？
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分化推斷知多少
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推斷軟件哪家強？？？
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強強聯(lián)手結(jié)果優(yōu)
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空間軌跡如何斷？？？
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方法總比困難多
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總結(jié)也是一種進步
生活很好，有你更好
