1，人類所有基因蛋白序列下載
數(shù)據(jù)庫(kù)地址：https://www.uniprot.org/tool-dashboard
1）進(jìn)入網(wǎng)頁(yè)，拉到最低端，點(diǎn)擊“Proteins (UniProtKB)”
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選擇展示形式，個(gè)人喜歡table
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2）選定物種和子庫(kù)（Swiss-Prot是校準(zhǔn)過的庫(kù)）
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3）選擇需要下載的信息
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選擇好后點(diǎn)“save”
4）選擇下載格式
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可以通過預(yù)覽看看格式和內(nèi)容是不是你要的：
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確定后點(diǎn)擊“download”
至此人類所有蛋白序列下載完成。其實(shí)除了蛋白序列外能下載的注釋信息還挺多，根據(jù)需要進(jìn)行下載吧~
2，獲取gene name、uniprotID、ensmbleID間對(duì)應(yīng)關(guān)系
你關(guān)注的基因列表可能是gene name，可能是uniprotID，可能是ensmbleID。。。。那么接下來你可能需要獲取ID間的對(duì)應(yīng)關(guān)系或者進(jìn)行ID轉(zhuǎn)換。推薦一個(gè)在線轉(zhuǎn)換ID的工具gprofiler。
工具地址：https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert
1）進(jìn)入網(wǎng)頁(yè)
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鍵入基因列表，選擇物種和目標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)：
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結(jié)果：
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導(dǎo)出即可。
