circos 中堆積柱狀圖的畫法

在之前的文章,我們介紹了如何使用histograms來(lái)構(gòu)建普通的柱狀圖,今天看下如何構(gòu)建堆積柱狀圖。

先來(lái)看一個(gè)堆積柱狀圖的例子


對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)如下:

和普通的柱狀圖相比,堆積柱狀圖只不過(guò)是第4列有多個(gè)value, 多個(gè)value 之間用逗號(hào)分隔。

配置文件的寫法如下:

大部分屬性和常規(guī)的柱狀圖是完全一樣的,需要注意的是其賦值的寫法。比如fill_color, 可以看到是逗號(hào)連接的5個(gè)顏色。對(duì)應(yīng)file中的5個(gè)value。

對(duì)于fill_colorthickness這兩個(gè)屬性來(lái)說(shuō),其值既可以是一個(gè)值,也可以是逗號(hào)連接的多個(gè)值。其值為一個(gè)是,代表所有的柱子屬性都一樣;為多個(gè)值時(shí),用逗號(hào)連接,每個(gè)柱子對(duì)應(yīng)一個(gè)屬性;如果屬性個(gè)數(shù)比value個(gè)數(shù)少是,會(huì)自動(dòng)循環(huán)。

下圖中有每個(gè)bin有5個(gè)柱子,但是fill_color只有兩個(gè)值,此時(shí)填充色的值自動(dòng)循環(huán),變成 red, black,red,black,red

thiockness在堆積柱狀圖中有了新的用途,可以看作每個(gè)柱子邊框的粗細(xì)程度,其值越大,在圖中柱子之間的間隔就越大。

在下圖中,可以看到隨著thickness的增大,不僅柱子之間的間隔變大了,對(duì)應(yīng)的填充色的區(qū)域整體都縮小了一圈。

在堆積柱狀圖中,有一個(gè)獨(dú)有的屬性sort_bin_values, 表示是否根據(jù)value的大小調(diào)整柱子的高度,默認(rèn)值為no, 柱子的順序按照file文件中指定的順序,第一個(gè)value 對(duì)應(yīng)最底部的柱子。當(dāng)取值為yes時(shí),柱子的順序會(huì)打亂,value最大的柱子在最底部。示意圖如下:

除了填充色之外,還可以設(shè)置pattern屬性,用法如下

pattern ? ?= vline,hline,solid,checker,solid

效果圖如下:

pattern的作用就是設(shè)置填充的樣式,比如斜線填充等樣式。

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