如何獲得一個(gè)基因的結(jié)構(gòu)域呢?CDD數(shù)據(jù)庫(kù)的使用


導(dǎo)師交給我一個(gè)基因,該怎么去查詢這個(gè)基因的保守結(jié)構(gòu)域,以便我后續(xù)對(duì)這個(gè)基因的進(jìn)一步研究呢?話不多說(shuō)直接上圖:

1. NCBI中CDD數(shù)據(jù)庫(kù)的查詢和使用

? ? 打開NCBI首頁(yè),選擇紅圈里的選項(xiàng)


2. 進(jìn)入CDD數(shù)據(jù)庫(kù),還是紅圈里的選項(xiàng)


3.? 進(jìn)入后有以下界面,如果是單條序列,直接進(jìn)入CD-Search選項(xiàng),如果要批量查詢,則進(jìn)入Batch-CD-

? ? ? Search。此處以單條序列為例進(jìn)行介紹。


4. 進(jìn)入CD-search后可直接粘貼核苷酸序列或者氨基酸序列到此框中。


5. 舉個(gè)栗子:

輸入我要查詢的序列后就有了下面的結(jié)果,這樣我就可以繼續(xù)去查和這個(gè)基因有關(guān)的文獻(xiàn),以及該結(jié)構(gòu)域的各種信息,為后續(xù)研究打下基礎(chǔ)。


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