做Western Blot的人,大概都經(jīng)歷過那樣的夜晚。
膜已經(jīng)封好,一抗按說明書稀釋,二抗也是剛配的,曝光前你甚至特意去洗了把手。然后走進暗室,放下膠片,等待。五秒、十秒、三十秒——拿出來一看,一片白茫茫,或者一片黑漆漆,唯獨沒有你想要的條帶。
那種時候,你通常會懷疑自己:是不是轉(zhuǎn)膜時間不對?封閉液該換新的了?還是今天的ECL顯影液恰好失效了?
其實,問題很可能出在一個你壓根沒想過的地方:一抗和二抗的搭配。
在優(yōu)品生物的實驗室里,我們每天都會接到這樣的求助電話。電話那頭的聲音,大多是研究生,有些已經(jīng)連著失敗了三四次,說話帶著一股子疲憊和克制。我們通常會先問一句:“您一抗和二抗的配對,做過梯度優(yōu)化嗎?”
電話那頭常常沉默幾秒鐘,然后反問:“這也要優(yōu)化?不是按說明書來就行了嗎?”
抗體配對,不是“1+1=2”那么簡單
如果把Western Blot比作一場演出,一抗是那個認出目標蛋白的“偵察兵”,二抗就是負責把信號放大的“宣傳隊”。偵察兵認準了人,宣傳隊才能把消息傳遞出去。但問題在于,這兩個角色之間的配合,遠沒有想象中那么簡單。
一抗有它的脾氣——不同批次、不同保存時間、不同稀釋比例,結(jié)合效率可以差出好幾倍。二抗也有它的性格——同樣是抗兔的,有的對背景蛋白特別“熱情”,有的則冷淡得多。把它們湊在一起,能不能配合好,真的需要“磨合”。
優(yōu)品生物的抗體研發(fā)團隊做過一個測試:同一批樣本,同一支一抗,搭配三支不同品牌的二抗。結(jié)果第一條背景干凈得像雪地,第二條雜帶比主帶還亮,第三條干脆什么也沒有。打電話給客服,客服說“我們的二抗沒問題,建議您查查一抗”??梢豢姑髅魇峭恢О ?/p>
抗體配對的本質(zhì),不是選“最好的”,而是選“最合適的”。
我們怎么幫你省這個心
三年前,優(yōu)品生物開始做一件事:每開發(fā)一支新抗體,不只是測它的效價、特異性、重復(fù)性,還會給它“配對”——找市面上主流的二抗挨個試一遍,記錄下哪些搭配效果最好,背景最低,信號最強。
這個數(shù)據(jù)庫,現(xiàn)在已經(jīng)有上千條記錄??蛻裟玫轿覀兊目贵w,說明書上除了常規(guī)的驗證數(shù)據(jù),還會多一行字:“推薦搭配XX品牌二抗,稀釋比例1:5000,信號強度可達峰值的90%以上;如用YY品牌二抗,建議比例調(diào)整為1:2000?!?/p>
聽起來簡單,做起來耗時又費力。但我們的技術(shù)負責人老周有句話掛在嘴邊:“給客戶省的時間,就是讓他們能早點回家睡覺的時間。”
有個用戶反饋很有意思。中科院某課題組,一個師妹連著做了兩個月磷酸化JNK的WB,條帶若有若無,導(dǎo)師都快對她失去信心了。后來她換用優(yōu)品生物的磷酸化JNK抗體,按推薦搭配重新優(yōu)化了二抗比例。第一次跑出來,條帶又亮又干凈。她拍照發(fā)給我們,附了一句話:“我終于可以畢業(yè)了。”
這話有點夸張,但我們知道她心里的石頭終于落地了-7。
梯度測試:用最小的成本,換最大的確定性
很多實驗室的習慣是:一支抗體買到手,說明書上寫1:1000,就永遠1:1000。背景高了,減一抗?jié)舛?;信號弱了,加一抗?jié)舛?。來回折騰好幾輪,一管抗體用完了,最佳條件還沒摸出來。
在優(yōu)品生物,我們建議的做法是:拿到新抗體,先做一次簡單的梯度測試。
取四個條帶,一抗稀釋比例分別設(shè)為1:500、1:1000、1:2000、1:4000,二抗用推薦的固定比例(比如1:5000)。跑完一看,哪個比例條帶最亮、背景最干凈,一目了然。這一步,多花半天時間,能省下后面幾個月走彎路的時間。
有經(jīng)驗的老師傅還會多做一步:確定一抗比例后,反過來再做二抗的梯度。1:2000、1:5000、1:10000、1:20000分別試一遍。最終找到的那個“黃金組合”,信號強度可能是原來的兩三倍,背景卻只有原來的一半。
優(yōu)品生物的技術(shù)支持團隊,每個月都會幫客戶做這樣的優(yōu)化方案。有次一個客戶發(fā)來一張圖,條帶歪歪扭扭,背景臟得像舊地毯。我們幫他重新設(shè)計了抗體配對方案,他回去重新跑了一板,第二天發(fā)來新圖,干干凈凈,數(shù)據(jù)完美-7。
抗體配對之外的那些事
當然,抗體選對了、配好了,也未必萬事大吉。
樣本制備那關(guān)過不去,蛋白降解了,什么抗體也救不回來。封閉時間不夠,膜上的空白位點沒堵住,二抗照樣會往里鉆,背景該高還是高。洗滌不徹底,非特異性結(jié)合沒洗掉,條帶照樣臟。轉(zhuǎn)膜有氣泡,蛋白沒轉(zhuǎn)到膜上,抗體再厲害也找不到目標。
這些都是細節(jié),但細節(jié)決定成敗。
優(yōu)品生物的抗體說明書,現(xiàn)在越來越厚。除了常規(guī)的驗證數(shù)據(jù)、推薦稀釋比例、推薦配對二抗,還加了一欄“常見問題排查”。比如“條帶位置偏高怎么辦”“出現(xiàn)多條帶怎么處理”“背景深如何調(diào)整”。每一條都是技術(shù)團隊從成千上萬個客戶反饋里總結(jié)出來的經(jīng)驗。
有位老師說過一句話,我們一直記得:“好的產(chǎn)品,不是讓客戶去適應(yīng)它,而是讓它去適應(yīng)客戶。”
少走一步彎路,就早一天出結(jié)果
做科研的人,時間是最貴的。一張膜跑壞了,不只是浪費幾十塊錢的試劑,更是浪費一整天的心血,浪費等結(jié)果時的那份期待。
優(yōu)品生物做抗體配對這件事,初衷很簡單:讓每一個拿到我們抗體的客戶,少走一步彎路。不用自己從頭摸索,不用在各種論壇里翻帖子找答案,不用靠“感覺”去猜今天該用什么比例。
我們替你把該試的都試了,該踩的坑先踩一遍,然后把那條最順的路指給你。
有客戶說,你們這服務(wù)太“保姆”了。我們聽了挺高興。做科研已經(jīng)夠累的了,能在抗體配對這件小事上幫你省點心,讓你把精力放在更重要的科學問題上,挺好。
下次再做WB,不妨試試優(yōu)品生物的抗體,順便看看推薦配對的二抗是哪支。說不定,困擾你幾個月的條帶,就這么輕輕松松跑出來了。
畢竟,有些彎路,不必每個人都走一遍。