問題 12. 為什么我可視化基因結(jié)構(gòu),只看到一堆黑線?

問題

TBtools 提供了我自認(rèn)為 全網(wǎng)最簡便易用的 本地基因結(jié)構(gòu)可視化工具。目前也有一定的用戶。但是有時(shí)候會(huì)遇到這樣的問題。


解決

事實(shí)上,很多參數(shù)都已經(jīng)提供了。但是有部分用戶仍然不知道如何更好地使用。
上述問題很簡單,用戶要一次性展示600多個(gè)基因的基因結(jié)構(gòu)。。。。很久以前,我一次性展示數(shù)十個(gè)物種的1200+個(gè)基因,完全沒問題。所以這個(gè)也不會(huì)有問題。

目前,TBtools 有兩個(gè)工具可以可視化基因結(jié)構(gòu),其實(shí)對(duì)應(yīng)的是 兩代繪圖引擎,一個(gè)是舊版的,JJplot2,一個(gè)是新版的,JIGplot。我個(gè)人推薦后者。
不過此處先講以下前者,

JJplot2 對(duì)應(yīng)的工具

使用擬南芥 1000+ 個(gè)基因


可以看到,顯示出來,都是黑線,跟上述的那個(gè)用戶結(jié)果一樣


注意到下方有個(gè)摁鈕【用GUI工具,要自己機(jī)靈一點(diǎn),參數(shù)基本都在摁鈕等等】

這不就搞定了嗎?

JIGplot 的情況


默認(rèn)情況下,結(jié)果 類似,畢竟是1000個(gè)基因。
注意到右側(cè)有Height,修改這個(gè)指標(biāo),重新可視化


這不就搞定了嗎?

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容