UCSC Genome Browser數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址

https://genome.ucsc.edu/

UCSC Genome Browser:

UCSC基因組瀏覽器是由Universityof California Santa Cruz(UCSC)基因組學(xué)研究所的跨部門團隊Genome Bioinformatics Group開發(fā)和維護。該網(wǎng)站已發(fā)展為包括大量的脊椎動物和模型生物的裝配體和注釋信息,以及用于查看、分析和下載數(shù)據(jù)的大量工具。

UCSC Genome Browser功能:

基因組可視化、查詢序列或基因、豐富的Tracks(基因組序列上對應(yīng)區(qū)域的各種注釋信息,包括表型與文獻、mRNA與表達序列標(biāo)簽EST、基因表達、調(diào)控、比較基因組學(xué)、SNP位點、重復(fù)序列等)、以文本格式檢索與Track相關(guān)的數(shù)據(jù)(Table Browser)、基因功能介紹(Gene Sorter)、序列比對(blat)、模擬PCR(In-SilicoPCR)、不同版本基因組間染色體位置轉(zhuǎn)換(LiftOver)、查找啟動子序列、數(shù)據(jù)下載等。

英文版操作指南

https://www.nature.com/scitable/ebooks/guide-to-the-ucsc-genome-browser-16569863/contents/

中文版操作指南

https://wenku.baidu.com/view/55edd1be3868011ca300a6c30c2259010302f338.html?fr=search

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