寫(xiě)在前面：如果你不知道順式作用元件是什么？請(qǐng)翻閱之前的文章：順式作用元件的認(rèn)識(shí)、查找、分析
正文在這：今天有一個(gè)小伙伴在公眾號(hào)私信問(wèn)我PLACE數(shù)據(jù)庫(kù)怎么用
然而對(duì)于長(zhǎng)期使用PLANTCARE的我來(lái)說(shuō)，這個(gè)問(wèn)題有點(diǎn)超綱。
不過(guò)沒(méi)事，不懂咱就學(xué)，還能咋滴是不是，畢竟實(shí)驗(yàn)汪的核心競(jìng)爭(zhēng)力就來(lái)源于非常有耐心，學(xué)的快，上手快。
首先，最常用的兩個(gè)分析網(wǎng)站的區(qū)別是？
植物順式作用調(diào)控元件（PLANTCARE）數(shù)據(jù)庫(kù)不僅收錄了植物順式作用元件，而且收錄了植物增強(qiáng)子（enhancer）和抑制子（inhabitor）。
植物DNA順式作用調(diào)控元件（PLACE）數(shù)據(jù)庫(kù)是從已發(fā)表文獻(xiàn)中搜集的植物的DNA順式作用元件的基序（motif），該數(shù)據(jù)庫(kù)標(biāo)注了每個(gè)基序和相關(guān)文獻(xiàn)摘要，但是僅包含維管植物。
來(lái)源于：王秋巖,何淑雅,馬云,李俐娟,李斌元.啟動(dòng)子分析方法的研究進(jìn)展[J].現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2015, 15(14):2794-2800.
其次，兩個(gè)分析網(wǎng)站的分析結(jié)果如何分析？
PLANTCARE的結(jié)果應(yīng)不用多說(shuō)吧，花花綠綠的元件，點(diǎn)擊小加號(hào)，來(lái)源物種，具體位置和motif，功能一目了然。
但是PLACE的結(jié)果就讓人有點(diǎn)不知所措了，密密麻麻的小子，整體顏色也讓人感覺(jué)很嚴(yán)肅。
以上圖為例，首先1199是你輸入序列的堿基數(shù)，（+）（-）則分別表示motif是正向（5’——》3‘）還是反向；接下來(lái)，讓我們點(diǎn)開(kāi)藍(lán)色小字S000265，頁(yè)面自動(dòng)跳轉(zhuǎn)到其詳細(xì)內(nèi)容
如果你想看懂這個(gè)結(jié)果，就一定要明白左側(cè)的字母含義，所有含義均在下方列出，相信聰明的你肯定一看就懂哈。
ID, a unique identifier；
AC, a unique accession number；?同S000XXX
DT, date of update；
DE, a brief description of the motif；主要也就是看看這里。
KW, keywords；
OS, common name and/or scientific name of plant species；
RA, author name(s) of a relevant report；?
RT, title of the report；
RL, bibliographic information of the report；?
RD, PubMed ID numbers (of MEDLINE database at NCBI-NIH, USA) and/or GenBank accession number, where available；這里需要注意的是，并不是每個(gè)reference都有PubMed?ID，如果有的話，恭喜，你可以點(diǎn)擊PubMed?ID直達(dá)原文。
(repeat RA to RD for up to seven reports)；?
SQ, motif sequence。
怎么樣，簡(jiǎn)簡(jiǎn)單單，
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