今天學習內(nèi)容為R語言基礎學習，R語言作為最早用于統(tǒng)計學的語言，現(xiàn)在已經(jīng)逐漸發(fā)展成較為完整的數(shù)據(jù)分析及可視化的生態(tài)，之前嘗試過一些R包，感覺R的掌握難度是要大于python的，語法語句上R看似簡單，但作為生信學習來說，需要使用的package內(nèi)語法使用規(guī)則參差不齊，所以理解R包有時確實費時費力，多學多看做嘗試希望會有提升！

1.R及Rstudio下載

可以把R及Rstudio當作兩個軟件，找到安裝包即可安裝：

官網(wǎng)下載總不會錯：

安裝R：清華鏡像（清華鏡像R語言）
安裝Rstudio：官網(wǎng)免費下載(Rstudio)

我平時習慣將軟件安裝單獨盤內(nèi)，所以此次我把安裝目錄更改了，其余一路傻瓜式下一步就可以了（這個習慣有好處自然也有壞處，因為有些軟件需要設置環(huán)境變量，有時盲目更改后續(xù)還需要重新設置系統(tǒng)環(huán)境路徑）。

這次學習花花前輩提示到Rstudio需要windows系統(tǒng)的用戶名必須是英文，之前沒有注意到，這幫我們規(guī)避了一個大坑！感謝！

R個人而言其實用過一小短時間，但也只停留在基本的文件管理與循環(huán)可視化等語法，進階之路還是路漫漫??！

包治百病，在R里同樣適用！(感慨一下：ggplot新人上手吐了！)

2.認識R及Rstudio

來源生信星球 花花老師

基本畫圖

1.plot(rnorm(50))

rnorm()：生成正態(tài)分布隨機數(shù)
runif()：生成均勻分布隨機數(shù)

R繪圖1

2.boxplot(irisSpecies,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))

R boxplot

3.R語言基本操作

a.Rproject管理工作目錄（通過新建Rproject將不同項目相對獨立區(qū)分），很有必要有時多個項目同時進行，這樣可以相對獨立；
b.顯示文件列表

• dir()（顯示默認路徑，相當于linux中的ls）
• list.files()（查看工作目錄文件夾中文件數(shù)目及信息）
• 數(shù)學基本運算（enter鍵出結(jié)果）
• 賦值（<- /=）
• 刪除變量（rm()，tab鍵補齊）
• 列出歷史命令（history()，雙擊某歷史命令即可出現(xiàn)在控制臺中）
• 清空控制臺（ctrl+l同時按）

4.R語言繪圖的一點想法

R語言可視化的生態(tài)現(xiàn)在非常龐大，學習資源很多，但現(xiàn)在強行理解有時不知所云，系統(tǒng)學習總覺得沒有足夠時間，這是最頭疼的！

扒代碼這件事如果R基礎不是特別好，很容易陷入報錯蒙圈死循環(huán)，ggplot也已經(jīng)折磨我許久了，但強迫癥又想畫出想要的完美的繪圖！

如此往復心態(tài)炸裂n次后，還是覺得得腳踏實地多學多看多練，期待有一天在想Jimmy、豆豆花花這樣的前輩們的帶領下也能繪出自己滿意的圖吧！

慣例思維導圖結(jié)尾！

思維導圖