設(shè)計(jì)qPCR引物

1.打開Primer3Plus在線網(wǎng)頁(https://www.primer3plus.com/)進(jìn)行設(shè)計(jì)引物;

2.輸入序列(目的基因的CDS的核酸序列);

輸入序列

3.進(jìn)行產(chǎn)物長度、引物大小等的設(shè)定(如圖所示)

對(duì)產(chǎn)物長度(一般為80-150bp)、引物長度、退火溫度及GC含量設(shè)定

4.點(diǎn)擊pick primers后得到結(jié)果;

結(jié)果展示

5.利用DNAMAN檢測(cè)引物是否存在發(fā)卡結(jié)構(gòu):打開DNAMAN軟件,點(diǎn)擊primer-Load primer-From Input,輸入Forward引物;點(diǎn)擊Primer-Two Primer Complementarity-Second primer From Input,即可查看引物能否形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)。

檢測(cè)結(jié)果(一般選擇少于四個(gè)發(fā)卡結(jié)構(gòu)的引物)

6。滿足條件的即可確定為比較好的qPCR引物,發(fā)送至公司郵箱合成即可。

這只是設(shè)計(jì)qPCR引物的其中一種方法,大家可以選擇自己熟悉的方法進(jìn)行設(shè)計(jì)。

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