在集群運(yùn)行腳本（python，perl，sh）時會遇到一些錯誤?？偨Y(jié)一下，以防手忙腳亂。(更新中）
很基礎(chǔ)的，自己打字玩。

1. 明明已經(jīng)安裝了python的模塊，運(yùn)行的時候就是會報錯找不到模塊

比如

$ python filter.py >Musa_a
Traceback (most recent call last):
  File "filter.py", line 1, in <module>
    from Bio import SeqIO
ModuleNotFoundError: No module named 'Bio'

解決辦法：在python腳本第一行添加#!usr/bin/python，讓腳本運(yùn)行時解析到這是python腳本，從而正常運(yùn)行。

2.perl類似的情況，

自己安裝的perl模塊不夠用，或者安裝了找不到，對于別人已經(jīng)寫好的腳本不容易修改。
解決辦法：可以用類似上面的方法試試，或者可以另外寫一個sh腳本運(yùn)行時規(guī)定使用哪個路徑下的perl（比如師兄的perl）

#!usr/bin/bash
unset PERL5LIB; export PATH=/shixiong/softs/perl-5.30.2/bin:$PATH
perl *&^*&^.pl 

3.同樣類似的，軟件命令找不到的話

可以在~/.bashrc文件中添加PATH，有點(diǎn)像windows在桌面創(chuàng)建快捷方式。一般路徑要到bin，系統(tǒng)會去bin的文件夾里面找運(yùn)行的腳本（軟件）
或者寫一個sh腳本專門記錄軟件路徑，和運(yùn)行的命令。