批次效應(yīng)學(xué)習(xí)

首先是學(xué)習(xí)優(yōu)秀的帖子

最近處理數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)同一個平臺的RNA-seq或者芯片數(shù)據(jù)，不同的樣本之間有時候竟然存在很大的差異，也就是所謂的批次效應(yīng)。因此學(xué)習(xí)了一下，并推薦一下優(yōu)秀的推文，主要來自生信技能樹、生信星球和果子學(xué)生信三個公眾號的推文。
到底是批次效應(yīng)還是真實生物學(xué)差異
不同的GSE數(shù)據(jù)集有不同的臨床信息，不同的分組技巧

GSE83521/GSE89143數(shù)據(jù)集-需去除批次效應(yīng)

多種批次效應(yīng)去除的方法比較

校正批次效應(yīng)

生信技能樹論壇的生信基礎(chǔ)板塊-統(tǒng)計學(xué)

GEO 批次效應(yīng)就靠一個函數(shù)搞定

批次效應(yīng)不得不防

批次效應(yīng)這樣矯正

批次效應(yīng)有時候真麻煩！

學(xué)習(xí)使用sctransform去除批次效應(yīng)

單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)校正批次效應(yīng)實戰(zhàn)（上）

單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)校正批次效應(yīng)實戰(zhàn)（中）

?單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)校正批次效應(yīng)實戰(zhàn)（下）

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