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為了不讓大家再走我之前自學(xué)生信時(shí)候踩過(guò)的坑，走過(guò)的彎路，將一些比較重要的入門書籍，網(wǎng)站和后續(xù)的學(xué)習(xí)渠道總結(jié)如下，供大家參考。

統(tǒng)計(jì)學(xué)

StatQuest

生物統(tǒng)計(jì)學(xué)視頻，包含統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)和生信所涉及的統(tǒng)計(jì)學(xué)概念，作者力圖用可視化并結(jié)合有意思的例子來(lái)讓統(tǒng)計(jì)學(xué)菜鳥(niǎo)盡快熟悉內(nèi)部原理。

作者是國(guó)外的大神，所以他的教程是全英文，在YouTube上首發(fā)。后來(lái)國(guó)內(nèi)的B站UP取得作者授權(quán)，將視頻傳到國(guó)內(nèi)并配上了中文字幕，后邊代碼也是這個(gè)UP主上傳的。

YouTube：https://www.youtube.com/playlist?list=PLblh5JKOoLUJo2Q6xK4tZElbIvAACEykp

B站網(wǎng)址：https://space.bilibili.com/257347536?from=search&seid=13661736885600696159

一部分R代碼：https://pan.baidu.com/s/1GQXa0P0_vX_bHgrWVEmAYA 提取碼：c2wk
深入淺出統(tǒng)計(jì)學(xué)

用大量例子來(lái)講解統(tǒng)計(jì)學(xué)的一些概念，如果不習(xí)慣英語(yǔ)視頻，可以先用這本書來(lái)熟悉。

系統(tǒng)操作

鳥(niǎo)哥的Linux私房菜基礎(chǔ)學(xué)習(xí)篇

生信的大部分軟件和分析流程都需要依靠服務(wù)器來(lái)做，因此避免不了Linux的使用。開(kāi)始學(xué)習(xí)不用背全部命令，常用命令和參數(shù)輸入多遍就會(huì)記住，如果對(duì)某個(gè)命令想深入學(xué)習(xí)，可以將這本書翻開(kāi)看看。
鳥(niǎo)哥的Linux私房菜：服務(wù)器架設(shè)篇

如果今后不涉及數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)或其他運(yùn)維工作，這本書可以不看，只做了解。

編程語(yǔ)言

R語(yǔ)言實(shí)戰(zhàn)

R語(yǔ)言是目前生信數(shù)據(jù)處理的主要編程語(yǔ)言，涵蓋大量的包來(lái)處理不同的生信需求，因此對(duì)于R語(yǔ)言的學(xué)習(xí)必不可少。
ggplot2：數(shù)據(jù)分析與圖形藝術(shù)

某種意義上講，R吸引人們使用它的重要原因就是這個(gè)包的存在。它提供了大量的可設(shè)置的可視化操作方式，幾乎可以繪制出任何用戶想繪制的圖形。

下面是利用ggplot2繪制的圖形
廖雪峰 Python 教程

網(wǎng)站簡(jiǎn)潔大方，教程附帶大量例子，可以使新手快速進(jìn)入python的學(xué)習(xí)中。

網(wǎng)址：https://www.liaoxuefeng.com/wiki/1016959663602400
Python基礎(chǔ)教程

Python 同樣逐步進(jìn)入生信領(lǐng)域，包括Pandas，Matlibplot，Biopython等庫(kù)都可以方便的執(zhí)行生信分析任務(wù)。同樣，也包含一些機(jī)器學(xué)習(xí)包，可以用于生物信息學(xué)的工作中。
Biopython 包

一般生信分析腳本的工具集。包括核酸序列處理，NCBI，UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)操作等其他常用的生信工具。

中文教程：https://biopython-cn.readthedocs.io/zh_CN/latest

英文教程：http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html

GitHub：https://github.com/biopython/biopython
pandas 包

用于分析結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的python包，包括對(duì)數(shù)據(jù)去空值，統(tǒng)計(jì)值計(jì)算，添加，刪除，插入，修改，提取等等操作。由于底層基于C，所以可以處理大型文件而且具有很快的分析速度。

英文教程：https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/getting_started/10min.html
Matlibplot 包

其實(shí)就是在python環(huán)境中的MATLAB （科學(xué)制圖里大神級(jí)的軟件），而且和它語(yǔ)法結(jié)構(gòu)和用法大致相同。

相當(dāng)于上邊提到的ggplot2，只是一個(gè)運(yùn)行與R環(huán)境一個(gè)是Python環(huán)境里的可視化工具包，這兩款看個(gè)人喜好來(lái)學(xué)習(xí)一個(gè)，另一個(gè)了解就好。

英文教程：https://matplotlib.org/

生物學(xué)

細(xì)胞生物學(xué)，翟中和

當(dāng)年考試時(shí)候用的書，對(duì)涉及的細(xì)胞的知識(shí)做了全方位的解釋。

分子生物學(xué)，朱玉賢

當(dāng)年考試時(shí)候用的書，對(duì)這本書的理解，關(guān)系都后面對(duì)生信分析的理解。比如在數(shù)據(jù)分析中的基因組比對(duì)，轉(zhuǎn)錄本定量，單位點(diǎn)突變分析，測(cè)序里的接頭，UMI，Barcode等等一些概念的理解。
**基因X，Lewin **

包含大量的文字和精美的配圖來(lái)極致詳盡的解釋生物學(xué)過(guò)程，唯一的缺點(diǎn)就是太厚。

學(xué)習(xí)渠道（單純好用，不是廣告）

Rosalind

網(wǎng)址：http://rosalind.info/problems/locations/

通過(guò)編程來(lái)生物信息學(xué)實(shí)戰(zhàn)的英文網(wǎng)站，提供了大量的試題，用戶能在線提交來(lái)完成。

在正確提交后，可以通過(guò)評(píng)論來(lái)看世界各地的人們對(duì)同一道題的不同解法。
生信菜鳥(niǎo)團(tuán)

公眾號(hào)，適合生信初學(xué)者，包括常用軟件，格式，流程的教程，主要由文獻(xiàn)推薦，幫助新手快速進(jìn)入生信狀態(tài)。
生信技能樹(shù)

包含論壇和公眾號(hào)，有高質(zhì)量的推文，包括生信分析的方法，軟件教程，生信會(huì)議信息，還有彩蛋和吐槽推文。
生信人

公眾號(hào)，生信文獻(xiàn)的推文，研究方法的教程
宏基因組

公眾號(hào)，主要發(fā)微生物方面的推文，也包含生信分析的教程