一. 運(yùn)維
1. Master掛掉,standby重啟也失效
Master默認(rèn)使用512M內(nèi)存,當(dāng)集群中運(yùn)行的任務(wù)特別多時,就會掛掉,原因是master會讀取每個task的event log日志去生成spark ui,內(nèi)存不足自然會OOM,可以在master的運(yùn)行日志中看到,通過HA啟動的master自然也會因為這個原因失敗。
解決
-
增加Master的內(nèi)存占用,在Master節(jié)點
spark-env.sh中設(shè)置:export SPARK_DAEMON_MEMORY 10g # 根據(jù)你的實際調(diào)整 -
減少保存在Master內(nèi)存中的作業(yè)信息
spark.ui.retainedJobs 500 # 默認(rèn)都是1000 spark.ui.retainedStages 500
2. worker掛掉或假死
有時候我們還會在web ui中看到worker節(jié)點消失或處于dead狀態(tài),在該節(jié)點運(yùn)行的任務(wù)則會報各種 lost worker 的錯誤,引發(fā)原因和上述大體相同,worker內(nèi)存中保存了大量的ui信息導(dǎo)致gc時失去和master之間的心跳。
解決
-
增加Master的內(nèi)存占用,在Worker節(jié)點
spark-env.sh中設(shè)置:export SPARK_DAEMON_MEMORY 2g # 根據(jù)你的實際情況 -
減少保存在Worker內(nèi)存中的Driver,Executor信息
spark.worker.ui.retainedExecutors 200 # 默認(rèn)都是1000 spark.worker.ui.retainedDrivers 200
二. 運(yùn)行錯誤
1.shuffle FetchFailedException
Spark Shuffle FetchFailedException解決方案
錯誤提示
-
missing output location
org.apache.spark.shuffle.MetadataFetchFailedException: Missing an output location for shuffle 0missing output location -
shuffle fetch faild
org.apache.spark.shuffle.FetchFailedException: Failed to connect to spark047215/192.168.47.215:50268shuffle fetch faild當(dāng)前的配置為每個executor使用1core,5GRAM,啟動了20個executor
解決
這種問題一般發(fā)生在有大量shuffle操作的時候,task不斷的failed,然后又重執(zhí)行,一直循環(huán)下去,直到application失敗。
一般遇到這種問題提高executor內(nèi)存即可,同時增加每個executor的cpu,這樣不會減少task并行度。
- spark.executor.memory 15G
- spark.executor.cores 3
- spark.cores.max 21
啟動的execuote數(shù)量為:7個
execuoterNum = spark.cores.max/spark.executor.cores
每個executor的配置:
3core,15G RAM
消耗的內(nèi)存資源為:105G RAM
15G*7=105G
可以發(fā)現(xiàn)使用的資源并沒有提升,但是同樣的任務(wù)原來的配置跑幾個小時還在卡著,改了配置后幾分鐘就能完成。
2.Executor&Task Lost
錯誤提示
-
executor lost
WARN TaskSetManager: Lost task 1.0 in stage 0.0 (TID 1, aa.local): ExecutorLostFailure (executor lost) -
task lost
WARN TaskSetManager: Lost task 69.2 in stage 7.0 (TID 1145, 192.168.47.217): java.io.IOException: Connection from /192.168.47.217:55483 closed -
各種timeout
java.util.concurrent.TimeoutException: Futures timed out after [120 second] ERROR TransportChannelHandler: Connection to /192.168.47.212:35409 has been quiet for 120000 ms while there are outstanding requests. Assuming connection is dead; please adjust spark.network. timeout if this is wrong
解決
由網(wǎng)絡(luò)或者gc引起,worker或executor沒有接收到executor或task的心跳反饋。
提高 spark.network.timeout 的值,根據(jù)情況改成300(5min)或更高。
默認(rèn)為 120(120s),配置所有網(wǎng)絡(luò)傳輸?shù)难訒r,如果沒有主動設(shè)置以下參數(shù),默認(rèn)覆蓋其屬性
- spark.core.connection.ack.wait.timeout
- spark.akka.timeout
- spark.storage.blockManagerSlaveTimeoutMs
- spark.shuffle.io.connectionTimeout
- spark.rpc.askTimeout or spark.rpc.lookupTimeout
3.傾斜
錯誤提示
-
數(shù)據(jù)傾斜
數(shù)據(jù)傾斜 任務(wù)傾斜
差距不大的幾個task,有的運(yùn)行速度特別慢。
解決
大多數(shù)任務(wù)都完成了,還有那么一兩個任務(wù)怎么都跑不完或者跑的很慢,分為數(shù)據(jù)傾斜和task傾斜兩種。
-
數(shù)據(jù)傾斜
數(shù)據(jù)傾斜大多數(shù)情況是由于大量的無效數(shù)據(jù)引起,比如null或者"",也有可能是一些異常數(shù)據(jù),比如統(tǒng)計用戶登錄情況時,出現(xiàn)某用戶登錄過千萬次的情況,無效數(shù)據(jù)在計算前需要過濾掉。
數(shù)據(jù)處理有一個原則,多使用filter,這樣你真正需要分析的數(shù)據(jù)量就越少,處理速度就越快。sqlContext.sql("...where col is not null and col != ''")
具體可參考:
解決spark中遇到的數(shù)據(jù)傾斜問題
- 任務(wù)傾斜
task傾斜原因比較多,網(wǎng)絡(luò)io,cpu,mem都有可能造成這個節(jié)點上的任務(wù)執(zhí)行緩慢,可以去看該節(jié)點的性能監(jiān)控來分析原因。以前遇到過同事在spark的一臺worker上跑R的任務(wù)導(dǎo)致該節(jié)點spark task運(yùn)行緩慢。
或者可以開啟spark的推測機(jī)制,開啟推測機(jī)制后如果某一臺機(jī)器的幾個task特別慢,推測機(jī)制會將任務(wù)分配到其他機(jī)器執(zhí)行,最后Spark會選取最快的作為最終結(jié)果。
- spark.speculation true
- spark.speculation.interval 100 - 檢測周期,單位毫秒;
- spark.speculation.quantile 0.75 - 完成task的百分比時啟動推測
- spark.speculation.multiplier 1.5 - 比其他的慢多少倍時啟動推測。
4.OOM
錯誤提示
堆內(nèi)存溢出
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
解決
內(nèi)存不夠,數(shù)據(jù)太多就會拋出OOM的Exeception,主要有driver OOM和executor OOM兩種
driver OOM
一般是使用了collect操作將所有executor的數(shù)據(jù)聚合到driver導(dǎo)致。盡量不要使用collect操作即可。executor OOM
可以按下面的內(nèi)存優(yōu)化的方法增加code使用內(nèi)存空間
- 增加executor內(nèi)存總量,也就是說增加
spark.executor.memory的值 - 增加任務(wù)并行度(大任務(wù)就被分成小任務(wù)了),參考下面優(yōu)化并行度的方法
5.task not serializable
錯誤提示
org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure:
Task not serializable: java.io.NotSerializableException: ...
解決
如果你在worker中調(diào)用了driver中定義的一些變量,Spark就會將這些變量傳遞給Worker,這些變量并沒有被序列化,所以就會看到如上提示的錯誤了。
val x = new X() //在driver中定義的變量
dd.map{r => x.doSomething(r) }.collect //map中的代碼在worker(executor)中執(zhí)行
除了上文的map,還有filter,foreach,foreachPartition等操作,還有一個典型例子就是在foreachPartition中使用數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建連接方法。這些變量沒有序列化導(dǎo)致的任務(wù)報錯。
下面提供三種解決方法:
- 將所有調(diào)用到的外部變量直接放入到以上所說的這些算子中,這種情況最好使用foreachPartition減少創(chuàng)建變量的消耗。
- 將需要使用的外部變量包括
sparkConf,SparkContext,都用@transent進(jìn)行注解,表示這些變量不需要被序列化 - 將外部變量放到某個class中對類進(jìn)行序列化。
6.driver.maxResultSize太小
錯誤提示
Caused by: org.apache.spark.SparkException:
Job aborted due to stage failure: Total size of serialized
results of 374 tasks (1026.0 MB) is bigger than
spark.driver.maxResultSize (1024.0 MB)
解決
spark.driver.maxResultSize默認(rèn)大小為1G 每個Spark action(如collect)所有分區(qū)的序列化結(jié)果的總大小限制,簡而言之就是executor給driver返回的結(jié)果過大,報這個錯說明需要提高這個值或者避免使用類似的方法,比如countByValue,countByKey等。
將值調(diào)大即可
spark.driver.maxResultSize 2g
7.taskSet too large
錯誤提示
WARN TaskSetManager: Stage 198 contains a task of very large size (5953 KB). The maximum recommended task size is 100 KB.
這個WARN可能還會導(dǎo)致ERROR
Caused by: java.lang.RuntimeException: Failed to commit task
Caused by: org.apache.spark.executor.CommitDeniedException: attempt_201603251514_0218_m_000245_0: Not committed because the driver did not authorize commit
解決
如果你比較了解spark中的stage是如何劃分的,這個問題就比較簡單了。
一個Stage中包含的task過大,一般由于你的transform過程太長,因此driver給executor分發(fā)的task就會變的很大。
所以解決這個問題我們可以通過拆分stage解決。也就是在執(zhí)行過程中調(diào)用cache.count緩存一些中間數(shù)據(jù)從而切斷過長的stage。
8. driver did not authorize commit
driver did not authorize commit
9. 環(huán)境報錯
-
driver節(jié)點內(nèi)存不足
driver內(nèi)存不足導(dǎo)致無法啟動application,將driver分配到內(nèi)存足夠的機(jī)器上或減少driver-memoryJava HotSpot(TM) 64-Bit Server VM warning: INFO:os::commit_memory(0x0000000680000000, 4294967296, 0) failed;
error='Cannot allocate memory' (errno=12) -
hdfs空間不夠
hdfs空間不足,event_log無法寫入,所以ListenerBus會報錯,增加hdfs空間(刪除無用數(shù)據(jù)或增加節(jié)點)Caused by: org.apache.hadoop.ipc.RemoteException(java.io.IOException): File /tmp/spark-history/app-20151228095652-0072.inprogress could only be replicated to 0 nodes instead of minReplication (=1) ERROR LiveListenerBus: Listener EventLoggingListener threw an exception java.lang.reflect.InvocationTargetException -
spark編譯包與hadoop版本不一致
下載對應(yīng)hadoop版本的spark包或自己編譯。java.io.InvalidClassException: org.apache.spark.rdd.RDD; local class incompatible: stream classdesc serialVersionUID -
driver機(jī)器端口使用過多
在一臺機(jī)器上沒有指定端口的情況下,提交了超過15個任務(wù)。16/03/16 16:03:17 ERROR SparkUI: Failed to bind SparkUI java.net.BindException: 地址已在使用: Service 'SparkUI' failed after 16 retries!提交任務(wù)時指定app web ui端口號或是修改最大嘗試次數(shù)
--conf spark.ui.port=4100
--conf spark.port.maxRetries=50
-
中文亂碼
使用write.csv等方法寫出到hdfs的文件,中文亂碼。JVM使用的字符集如果沒有指定,默認(rèn)會使用系統(tǒng)的字符集,因為各個節(jié)點系統(tǒng)字符集并不都是UTF8導(dǎo)致,所以會出現(xiàn)這個問題。直接給JVM指定字符集即可。
spark-defaults.conf
spark.executor.extraJavaOptions -Dfile.encoding=UTF-8
三. 一些python錯誤
1.python版本過低
java.io.UIException: Cannot run program "python2.7": error=2,沒有那個文件或目錄
spark使用的python版本為2.7,centOS默認(rèn)python版本為2.6,升級即可。
2.python權(quán)限不夠
錯誤提示
部分節(jié)點上有錯誤提示
java.io.IOExeception: Cannot run program "python2.7": error=13, 權(quán)限不夠
解決
新加的節(jié)點運(yùn)維裝2.7版本的python,python命令是正確的,python2.7卻無法調(diào)用,只要改改環(huán)境變量就好了。
3.pickle使用失敗
錯誤提示
TypeError: ('__cinit__() takes exactly 8 positional arguments (11 given)',
<type 'sklearn.tree._tree.Tree'>, (10, array([1], dtype=int32), 1,
<sklearn.tree._tree.RegressionCriterion object at 0x100077480>,
50.0, 2, 1, 0.1, 10, 1, <mtrand.RandomState object at 0x10a55da08>))
4.python編碼錯誤
錯誤提示
UnicodeEncodeError: 'ascii' codec can't encode characters in position 0-1: ordinal not in range(128)
解決
方法1:
import sys
reload(sys)
sys.setdefaultencoding('utf-8')
方法2:
//報錯
str(u'中國')
//不報錯
str(u'中國'.encode('utf-8'))
解決
該pickle文件是在0.17版本的scikit-learn下訓(xùn)練出來的,有些機(jī)器裝的是0.14版本,版本不一致導(dǎo)致,升級可解決,記得將老版本數(shù)據(jù)清理干凈,否則會報各種Cannot import xxx的錯誤。
四. 一些優(yōu)化
1. 部分Executor不執(zhí)行任務(wù)
有時候會發(fā)現(xiàn)部分executor并沒有在執(zhí)行任務(wù),為什么呢?
(1) 任務(wù)partition數(shù)過少,
要知道每個partition只會在一個task上執(zhí)行任務(wù)。改變分區(qū)數(shù),可以通過 repartition 方法,即使這樣,在 repartition 前還是要從數(shù)據(jù)源讀取數(shù)據(jù),此時(讀入數(shù)據(jù)時)的并發(fā)度根據(jù)不同的數(shù)據(jù)源受到不同限制,常用的大概有以下幾種:
hdfs - block數(shù)就是partition數(shù)
mysql - 按讀入時的分區(qū)規(guī)則分partition
es - 分區(qū)數(shù)即為 es 的 分片數(shù)(shard)
(2) 數(shù)據(jù)本地性的副作用
taskSetManager在分發(fā)任務(wù)之前會先計算數(shù)據(jù)本地性,優(yōu)先級依次是:
process(同一個executor) -> node_local(同一個節(jié)點) -> rack_local(同一個機(jī)架) -> any(任何節(jié)點)
Spark會優(yōu)先執(zhí)行高優(yōu)先級的任務(wù),任務(wù)完成的速度很快(小于設(shè)置的spark.locality.wait時間),則數(shù)據(jù)本地性下一級別的任務(wù)則一直不會啟動,這就是Spark的延時調(diào)度機(jī)制。
舉個極端例子:運(yùn)行一個count任務(wù),如果數(shù)據(jù)全都堆積在某一臺節(jié)點上,那將只會有這臺機(jī)器在長期計算任務(wù),集群中的其他機(jī)器則會處于等待狀態(tài)(等待本地性降級)而不執(zhí)行任務(wù),造成了大量的資源浪費(fèi)。
判斷的公式為:
curTime – lastLaunchTime >= localityWaits(currentLocalityIndex)
其中 curTime 為系統(tǒng)當(dāng)前時間,lastLaunchTime 為在某優(yōu)先級下最后一次啟動task的時間
如果滿足這個條件則會進(jìn)入下一個優(yōu)先級的時間判斷,直到 any,不滿足則分配當(dāng)前優(yōu)先級的任務(wù)。
數(shù)據(jù)本地性任務(wù)分配的源碼在 taskSetManager.scala 。
如果存在大量executor處于等待狀態(tài),可以降低以下參數(shù)的值(也可以設(shè)置為0),默認(rèn)都是3s。
spark.locality.wait
spark.locality.wait.process
spark.locality.wait.node
spark.locality.wait.rack
當(dāng)你數(shù)據(jù)本地性很差,可適當(dāng)提高上述值,當(dāng)然也可以直接在集群中對數(shù)據(jù)進(jìn)行balance。
2. spark task 連續(xù)重試失敗
有可能哪臺worker節(jié)點出現(xiàn)了故障,task執(zhí)行失敗后會在該 executor 上不斷重試,達(dá)到最大重試次數(shù)后會導(dǎo)致整個 application 執(zhí)行失敗,我們可以設(shè)置失敗黑名單(task在該節(jié)點運(yùn)行失敗后會換節(jié)點重試),可以看到在源碼中默認(rèn)設(shè)置的是 0
private val EXECUTOR_TASK_BLACKLIST_TIMEOUT =
conf.getLong("spark.scheduler.executorTaskBlacklistTime", 0L)
在 spark-default.sh 中設(shè)置
spark.scheduler.executorTaskBlacklistTime 30000
當(dāng) task 在該 executor 運(yùn)行失敗后會在其它 executor 中啟動,同時此 executor 會進(jìn)入黑名單30s(不會分發(fā)任務(wù)到該executor)。
3. 內(nèi)存
如果你的任務(wù)shuffle量特別大,同時rdd緩存比較少可以更改下面的參數(shù)進(jìn)一步提高任務(wù)運(yùn)行速度。
spark.storage.memoryFraction - 分配給rdd緩存的比例,默認(rèn)為0.6(60%),如果緩存的數(shù)據(jù)較少可以降低該值。
spark.shuffle.memoryFraction - 分配給shuffle數(shù)據(jù)的內(nèi)存比例,默認(rèn)為0.2(20%)
剩下的20%內(nèi)存空間則是分配給代碼生成對象等。
如果任務(wù)運(yùn)行緩慢,jvm進(jìn)行頻繁gc或者內(nèi)存空間不足,或者可以降低上述的兩個值。
"spark.rdd.compress","true" - 默認(rèn)為false,壓縮序列化的RDD分區(qū),消耗一些cpu減少空間的使用
4. 并發(fā)
mysql讀取并發(fā)度優(yōu)化
spark 讀取 hdfs 數(shù)據(jù)分區(qū)規(guī)則
spark.default.parallelism
發(fā)生shuffle時的并行度,在standalone模式下的數(shù)量默認(rèn)為core的個數(shù),也可手動調(diào)整,數(shù)量設(shè)置太大會造成很多小任務(wù),增加啟動任務(wù)的開銷,太小,運(yùn)行大數(shù)據(jù)量的任務(wù)時速度緩慢。
spark.sql.shuffle.partitions
sql聚合操作(發(fā)生shuffle)時的并行度,默認(rèn)為200,如果該值太小會導(dǎo)致OOM,executor丟失,任務(wù)執(zhí)行時間過長的問題
相同的兩個任務(wù):
spark.sql.shuffle.partitions=300:
spark.sql.shuffle.partitions=500:
速度變快主要是大量的減少了gc的時間。
但是設(shè)置過大會造成性能惡化,過多的碎片task會造成大量無謂的啟動關(guān)閉task開銷,還有可能導(dǎo)致某些task hang住無法執(zhí)行。
修改map階段并行度主要是在代碼中使用rdd.repartition(partitionNum)來操作。
5. shuffle
spark-sql join優(yōu)化
map-side-join 關(guān)聯(lián)優(yōu)化
spark range join 優(yōu)化
6. 磁盤
7.序列化
8.數(shù)據(jù)本地性
Spark不同Cluster Manager下的數(shù)據(jù)本地性表現(xiàn)
spark讀取hdfs數(shù)據(jù)本地性異常
9.代碼
10.PySpark
PySpark Pandas UDF
在spark dataFrame 中使用 pandas dataframe
pypy on PySpark