劃重點(diǎn)啦!接下來主要講解的是:患者生存狀態(tài)的影響因素分析!

劃重點(diǎn)啦!接下來主要講解的是:患者生存狀態(tài)的影響因素分析!

00?前言:

大家好, 我們是科研風(fēng)雨路,點(diǎn)擊右上方“關(guān)注”,每天為你分享一些科研知識,共同進(jìn)步。劃重點(diǎn)啦!接下來主要講解的是:患者生存狀態(tài)的影響因素分析!

01準(zhǔn)備問題與數(shù)據(jù) :

?比如我要研究的問題是,某基因的表達(dá)量以及臨床性狀里面各項(xiàng)指標(biāo)與生存資料之間的關(guān)系。

? 以死亡為結(jié)局,每個(gè)研究對象的某基因的表達(dá)量以及臨床性狀里面各項(xiàng)指標(biāo)為主要研究因素,每個(gè)研究對象都有生存時(shí)間(隨訪開始到死亡、失訪或隨訪結(jié)束的時(shí)間)。

?欲了解每個(gè)研究對象的某基因的表達(dá)量以及臨床性狀里面各項(xiàng)指標(biāo)等因素對胃癌患者生存的影響是否有差異,可以用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型(Cox proportional-hazards model,也稱為Cox回歸)進(jìn)行分析。臨床研究中非常常用!

02

使用小技巧:

1、注意:?實(shí)際上,Cox回歸的結(jié)局不一定是死亡,也可以是發(fā)病、妊娠、再入院等。其共同特點(diǎn)是,不僅考察結(jié)局是否發(fā)生,還考察結(jié)局發(fā)生的時(shí)間。

2、注意:在進(jìn)行Cox回歸分析前,如果樣本不多而變量較多,建議先通過單變量分析(KM法繪制生存曲線、Logrank檢驗(yàn)等)考察所有自變量與因變量之間的關(guān)系,篩掉一些可能無意義的變量,再進(jìn)行多因素分析,這樣可以保證結(jié)果更加可靠。

?即使樣本足夠大,也不建議把所有的變量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各個(gè)變量之間的相互關(guān)系,確定自變量進(jìn)入方程的形式,這樣才能有效的進(jìn)行分析。

3、注意:單因素分析后,應(yīng)當(dāng)考慮應(yīng)該將哪些自變量納入Cox回歸模型。一般情況下,建議納入的變量有:

? ? ?1)單因素分析差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的變量(此時(shí),最好將P值放寬一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);

? ? ?2)單因素分析時(shí),沒有發(fā)現(xiàn)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,但是臨床上認(rèn)為與因變量關(guān)系密切的自變量。

03?cox回歸分析的意義

主要研究因素每個(gè)因素是否與我們的生存相關(guān),這是指單因素cox回歸分析,如果要研究多個(gè)因素是否與我們的生存相關(guān),這時(shí)就需要用到多因素cox回歸分析。

04?操作和得到的結(jié)果含義

關(guān)于如何操作得到的結(jié)果,以及得到結(jié)果的含義,具體根據(jù)我們生信的操作,得到結(jié)果后,進(jìn)行解析。

05?接下來的具體安排

以下是這幾天公眾號的安排:

?第一:使用腳本繪制配對差異圖,如果忘記了,可以回顧一下前一節(jié)的內(nèi)容,鏈接在這里啦!預(yù)計(jì)2分鐘。

第二:首先我們要從TCGA上下載臨床數(shù)據(jù),接下來是提取臨床數(shù)據(jù),然后進(jìn)行生存分析的文件準(zhǔn)備,再接下來是進(jìn)行生存分析,緊接著先準(zhǔn)備臨床相關(guān)性輸入文件,然后再進(jìn)行cox分析輸入文件的準(zhǔn)備,最后是單因素cox回歸分析和多因素cox回歸分析。

最后:各位小伙伴,覺得內(nèi)容對你有幫助,記得順手點(diǎn)個(gè)贊和在看喲,你小小的點(diǎn)贊和在看永遠(yuǎn)是我持續(xù)寫作的動(dòng)力,謝謝你。

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