1. 常見的分子間相互作用有哪些？

離子對相互作用, 離子-偶極相互作用, 偶極-偶極相互作用, 離子-誘導(dǎo)偶極作用, 偶極-誘導(dǎo)偶極作用, 范德華相互作用, 氫鍵, 鹵鍵, π效應(yīng), 疏水效應(yīng).

2. 以下溶劑極性順序：苯，甲醇，水，乙酸乙酯，丙酮，乙醚，石油醚？

水>甲醇>丙酮>乙酸乙酯>乙醚>苯>石油醚

3. 水和冰相比，哪個氫鍵網(wǎng)絡(luò)更規(guī)則？水為何4℃密度最大？

• 冰更規(guī)則, 形成四個氫鍵, 空間利用率低于水, 密度比水低.
• 水在4℃時密度最大, 溫度高了破壞分子間氫鍵, 分子間作用降低密度下降; 溫度低了會向冰的結(jié)構(gòu)靠近, 空間利用率下降, 密度下降.

4. logP為-1和2的兩個化合物，在液相色譜（C18柱）中哪個優(yōu)先出峰？

logP越大, 親脂性越強. 因為C18柱的LC為反相色譜, 極性大的化合物先出峰, 因此l一般地, logP為-1的化合物水溶性大, 極性也更大, 因此優(yōu)先出峰.

5. 既然存在正離子-π作用，為何KCl不溶于苯？

KCl 要溶于苯, 需要克服晶體中K+和Cl-的離子對作用(離子鍵)以及苯的π-π堆積相互作用, 盡管存在K+-π作用, 但其強度遠不如K+ Cl-的作用, 因此溶解性差.

6. 苯是非極性溶劑，氯仿是極性溶劑，何種作用力導(dǎo)致苯的汽化熱更大？

苯存在著四極距, 苯和苯分子之間存在π堆積相互作用, 而氯仿沒有該作用; 另外, 苯環(huán)具有較強誘導(dǎo)偶極作用, 其分子間的范德華作用也要強于氯仿. 這些作用使苯的汽化熱更大.

7. 分子對接的兩個基本問題是什么？分子對接有何用途？

采樣問題和打分問題. 分子對接用于預(yù)測配體分子和受體分子的結(jié)合模式, 同時提供相應(yīng)結(jié)合能力的預(yù)測, 被廣泛應(yīng)用于藥物的虛擬篩選當(dāng)中.
怎么進行一次分子對接實驗?zāi)??

8. 如何通過理論計算化合物的pKa值？

設(shè)計熱力學(xué)循環(huán)如下圖, 基于量化方法進行吉布斯自由能的計算.
pKa的計算公式參考圖中所示.

熱力學(xué)循環(huán)計算pKa

9. 三乙胺和碘乙烷的SN2反應(yīng)速率隨溶劑極性升高而提升，為什么？

作為反應(yīng)物的三乙胺和碘乙烷均不帶電荷,而在SN2的過渡態(tài)中, 三乙胺帶部分正電荷, 碘帶部分負(fù)電荷. 相比反應(yīng)物, 過渡態(tài)的極性更大, 因此極性提高能更有效穩(wěn)定過渡態(tài)結(jié)構(gòu), 從而導(dǎo)致活化能降低, 反應(yīng)速率提升.

10. 乙酰乙酸乙酯在極性溶劑中以酮式為主，而非極性溶劑中以烯醇式為主，為什么？

乙酰乙酸乙酯的烯醇式中存在著分子內(nèi)氫鍵作用, 因此在非極性溶劑下, 形成了分子內(nèi)氫鍵的更為穩(wěn)定的烯醇式結(jié)構(gòu)占主要; 當(dāng)溶劑極性增加, 會破壞分子內(nèi)氫鍵的作用, 本來酮結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性高于烯醇式, 因此會以酮式結(jié)構(gòu)為主.