大家好啊,這里是佳奧。
一直想有機(jī)會(huì)學(xué)習(xí)一下生信分析,一方面是提升自己的技能面,一方面是現(xiàn)在發(fā)文章的必須要求了。(目前做植物生理方面)
所以,綜上所述,暑假是一個(gè)很好的時(shí)間與機(jī)會(huì)。(由于不能留校讓我有了兩個(gè)半月假期,希望九月份我的材料沒事)
這里會(huì)記錄我從小白到,,,到可以看懂大佬的過程,學(xué)習(xí)的有關(guān)參考書籍感謝@陳有樸,能有幸交流真的很開心,那么我們開始吧。
本系列的全部內(nèi)容均參考《R語言實(shí)戰(zhàn)》
1 R與R Studio的安裝
R官網(wǎng):https://cran.r-project.org/
R Studio官網(wǎng):https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
先安裝R,再安裝R Studio,順序不要錯(cuò)了。
我第一次安裝的時(shí)候,R Studio一直彈窗顯示無法識(shí)別安裝了R,經(jīng)過排查原來是要兩個(gè)軟件安裝在同一目錄下,就可以了。(實(shí)在不行選擇第三個(gè)選擇,直接找到R的安裝文件也可以)
那么安裝完成后,就可以愉快玩耍了。
等一下,系統(tǒng)用戶名最好是不帶中文的,或許改工作目錄可以解決?我倒是重裝系統(tǒng)后改了命名,,,
讓我們開始吧。雙擊打開R Studio。
2 賦值和函數(shù)
我想令字符x等于5,就

我想令字符y等于包含1,2,3,4的函數(shù)

以上就是賦值和函數(shù)的內(nèi)容,然后我們就可以看一些自帶的圖示了。
3 demo演示
輸入

再按回車,右側(cè)的plot框就會(huì)顯示一些demo的圖示了。(看著好高級(jí))
4 補(bǔ)充
輸入

回車會(huì)計(jì)算出等于2,不錯(cuò),很好的計(jì)算器。
5 散點(diǎn)圖的輸入和分析
以上就是基礎(chǔ)的操作,那么我們就可以開始從散點(diǎn)圖入門,學(xué)習(xí)R的繪圖
首先假設(shè)我們的研究對(duì)象是杉木苗的生長情況,我們調(diào)查了不同時(shí)期的杉木苗苗高,數(shù)據(jù)如下

使用函數(shù) c( ) 以向量的形式輸入天數(shù)和苗高數(shù)據(jù),然后用其他函數(shù)獲得苗高的均值和標(biāo)準(zhǔn)差,天數(shù)與苗高的相關(guān)度,最后用圖形展示兩個(gè)數(shù)據(jù)的關(guān)系。具體代碼如下:
輸入天數(shù)和高度數(shù)據(jù):

計(jì)算苗高平均值:

得到平均值為18.89cm。
計(jì)算苗高標(biāo)準(zhǔn)差:

得到苗高標(biāo)準(zhǔn)差為10.39。
接著分析天數(shù)與苗高的線性相關(guān)性:

相關(guān)性為0.94,線性相關(guān)性比較強(qiáng)。
最后繪制天數(shù)與苗高的散點(diǎn)圖:


大功告成!我完成了使用R語言繪制的第一張圖。
那么這就是第一部分的內(nèi)容,我們下一篇再見?。ㄎ艺淼恼娴暮苈齩rz,但是會(huì)一直學(xué)的?。。?/p>