不論是heatmap, 還是scatter, histogram, 反映的都是基因組上某段區(qū)域?qū)?yīng)的value值的分布，這里的value都是數(shù)值。對于value是字符串的情況，專門定義了text這種圖表類型，用于展示。

看一個text圖片的實例

text在圖上就是一圈的字符串標(biāo)記，字符串可以添加連線，表明對應(yīng)的染色體位置。

配置文件的寫法如下：

首先看下file文件中的內(nèi)容， 示例如下

和scatter等圖表的內(nèi)容完全一致，只不過第4列是字符串，不是數(shù)值。

對于text而言，由于value不是數(shù)值，所以沒有max和min參數(shù)，其位置完全由r0和r1兩個參數(shù)的值決定。

其他的屬性可以分成以下兩個部分

1. 文字的屬性

對于文字，常用的屬性包括以下幾個

• 顏色
• 大小

• 字體

  
  

label_font定義字體；label_size定義大?。?code>color定義文字顏色
為了清楚的展示每個laebl, 所有的label之間是不會重疊的，如果兩個label距離過近，會出現(xiàn)重疊時，會自動堆積在一起。

有兩個參數(shù)label_snuggle和max_snuggle_distance控制具體的堆積情況。示意圖如下：

假設(shè)在基因組上62,000,000的位置上，有100個label。默認(rèn)情況下label_snuggle = no，所有的label會依次堆積在一起，超出范圍的不會顯示。為了多顯示label, 可以設(shè)置label_snuggle = yes, 此時可以和max_snuggle_distance參數(shù)結(jié)合使用，這個參數(shù)的值越大，可以顯示的label就越多。

2. 連線的屬性

默認(rèn)情況下是不顯示連線的，需要添加下列參數(shù)才能顯示連線

show_links ? ? = yes

對于連線，常用的屬性包括以下幾個

• 顏色

• 粗細(xì)

  
  

link_color定義顏色，link_thickness定義粗細(xì)。除了上述常見屬性外，還有一個links_dims屬性控制連線的形狀。

lnks_dims的示意圖如下

將連續(xù)分成了d1到d5共5個部分，決定的連線的形狀，用法如下

link_dims ? ? ?= 0p,0p,70p,0p,10p

最后需要注意的一點，就是rules的用法, 示例如下

由于value的值是一個字符串，所以使用的是perl中的字符串操作符，eq用于判斷兩個字符串相等，perl中的其他的字符串操作符也可以使用。

還可以使用正則表達(dá)式，示例如下

和perl中的語法是完全一樣的。

對于label的字體，有一個很特殊的取值

label_font = glyph

這種情況下，可以結(jié)合rules設(shè)置對應(yīng)的value，此時不再顯示字符串，而是顯示對應(yīng)的形狀，不同value 和 形狀之間的對應(yīng)關(guān)系如下

取值范圍為a-o,區(qū)分大小寫，大寫表示實心的點，小寫表示空心的點。

示例如下：

生成的圖片如下：

雖然圖表類型type = text, 但是圖上確沒有文字標(biāo)識的label， 而是由不同形狀的點構(gòu)成，點的形狀由rules定義。