??????? 隨著大型醫(yī)療機(jī)構(gòu)和檢測(cè)機(jī)構(gòu)樣本量的增多,如何高效快速地進(jìn)行核酸檢測(cè)成為研究者關(guān)注的重點(diǎn)。目前,醫(yī)療機(jī)構(gòu)以及檢測(cè)機(jī)構(gòu)幾乎都會(huì)首選血液樣本作為檢測(cè)標(biāo)本。血液DNA提取方法主要有磁珠法和硅膠膜離心柱法,由于離心柱法滿足不了日益增長(zhǎng)的大批量樣本檢測(cè)需求,在特定的檢測(cè)要求下,磁珠法逐漸成為追求自動(dòng)化作業(yè)的工作者進(jìn)行DNA提取的理想手段。

??????? 很多廠家推出了商品化的磁珠法血液DNA提取試劑盒,這解決了很多血液核酸研究者的實(shí)際問題。但是,現(xiàn)在大部分的磁珠法血液DNA提取試劑盒都是配套廠家自產(chǎn)的核酸提取儀,那么如何選擇一款合適的磁珠法血液DNA提取試劑盒呢?
??????? 目前,我們常用的磁珠法血液DNA提取試劑盒主要有進(jìn)口品牌Q、國(guó)內(nèi)品牌Biog以及國(guó)內(nèi)品牌T?,F(xiàn)在我們就這幾種磁珠法血液DNA提取試劑盒進(jìn)行比較。
?????? ?就磁珠法來說,血液DNA提取試劑盒的性能是我們?cè)谶x擇產(chǎn)品時(shí)首要考慮的因素。一般地,DNA提取試劑盒的性能無(wú)外乎DNA提取得率、核酸純度、檢測(cè)敏感性、操作簡(jiǎn)便性等。
???????一、DNA提取得率。對(duì)于血液樣本,DNA提取得率主要取決于裂解液對(duì)樣本的裂解消化能力、磁珠對(duì)核酸的吸附能力、洗脫液對(duì)核酸的洗脫能力。DNA提取得率可以通過紫外分光光度計(jì)法測(cè)得,但是結(jié)果僅供參考,不能作為判斷得率的唯一標(biāo)準(zhǔn),如果要精確檢測(cè)DNA得率,還是要做PCR或熒光定量的。樣本量與DNA得率成正比,結(jié)果不理想可以通過增加血液樣本量來提高DNA得率。如果樣本量的增加還是不能改善DNA得率,那么就應(yīng)該及時(shí)考慮更換試劑盒了。
????? 根據(jù)我們實(shí)驗(yàn)室的經(jīng)驗(yàn),Q公司磁珠法血液DNA的提取得率,一般200ul血液樣本在2.6-6ug。Biog與Q的DNA提取得率相近,200ul血液樣本在3-5ug;T公司 200ul血液樣本DNA得率在4-8ug,基本上都能滿足下游PCR實(shí)驗(yàn)的要求。
????? ?二、核酸純度。這幾個(gè)品牌的血液DNA提取試劑盒得到的DNA純度略有差別,國(guó)內(nèi)品牌Biog和T的核酸提取純度差不多,可以直接應(yīng)用于PCR、qPCR、病毒檢測(cè)、分子雜交等。進(jìn)口品牌Q的純度略高,除了以上應(yīng)用,還可用于對(duì)純度要求略高的實(shí)驗(yàn),如基因分型、二代測(cè)序等。目前,血液DNA提取主要應(yīng)用于易感基因檢測(cè)、PCR、qPCR、分子雜交等,國(guó)產(chǎn)試劑盒Biog、T基本都能滿足要求。
?????? 三、檢測(cè)敏感性。經(jīng)過一段時(shí)間的研究,我們實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在同樣實(shí)驗(yàn)條件下,國(guó)內(nèi)品牌Biog與進(jìn)口Q提取的血液DNA檢測(cè)的CT值相差不大,基本控制在1個(gè)CT值內(nèi);而國(guó)產(chǎn)品牌T提取的血液DNA檢測(cè)CT值較大,一般比Q晚1-2個(gè)CT值,檢測(cè)敏感性不如Biog、Q這兩個(gè)品牌。
?????? 四、操作簡(jiǎn)便性。由于磁珠法核酸提取需要自動(dòng)化操作,如果操作過于復(fù)雜,不僅耗時(shí),還容易導(dǎo)致樣本間的交叉污染,也容易損失樣本。特別地,對(duì)于臨床檢測(cè)或樣本較多情況下的檢測(cè),交叉污染會(huì)引起誤診,還會(huì)影響出檢測(cè)報(bào)告的時(shí)間。因而,選用操作簡(jiǎn)便、流暢的血液DNA提取試劑盒非常重要。以上三種提取試劑盒,Q公司的血液DNA提取試劑盒提取運(yùn)行過程一般15-20min;T公司血液DNA提取試劑盒整個(gè)提取過程需要近1個(gè)小時(shí);B公司的Biog磁珠法通用核酸提取試劑盒(特別適用于血液DNA/RNA提?。┨崛∵^程只需20多分鐘。Q公司和Biog公司磁珠法血液DNA提取試劑盒在操作簡(jiǎn)便性上具有絕對(duì)優(yōu)勢(shì),耗時(shí)短,更適合于大批量樣本的檢測(cè)。
?????? ?五、儀器兼容性。據(jù)了解,Biog、T品牌的磁珠法血液DNA提取試劑盒可以手工采用磁力架操作,也可配套多種型號(hào)自動(dòng)化核酸提取儀使用,但是進(jìn)口品牌Q一般需要配套Q廠家自產(chǎn)核酸提取儀使用。所以,雖然我們實(shí)驗(yàn)室有核酸提取儀,也是考慮到進(jìn)口試劑、耗材昂貴,實(shí)驗(yàn)成本高而無(wú)奈放棄選用Q公司產(chǎn)品,我們更傾向于選擇儀器兼容性好的試劑盒。
???????六、產(chǎn)品價(jià)格。價(jià)格也是影響客戶選擇產(chǎn)品的一個(gè)重要因素。對(duì)于絕大多數(shù)實(shí)驗(yàn)如PCR、qPCR、基因檢測(cè)、分子雜交等,國(guó)產(chǎn)試劑盒都能滿足質(zhì)量要求。與國(guó)外知名品牌相比,國(guó)產(chǎn)試劑盒的價(jià)格較為便宜,一般只有國(guó)外品牌價(jià)格的30%,性價(jià)比較高;國(guó)產(chǎn)試劑盒Biog比T價(jià)格略優(yōu)。因而,對(duì)于以上實(shí)驗(yàn)建議選用Biog、T等國(guó)產(chǎn)試劑盒。對(duì)提取DNA的純度要求相對(duì)較高的一些研究,如基因分型、測(cè)序、細(xì)胞轉(zhuǎn)染等,可考慮選用Q等國(guó)外知名品牌。
???????綜上,國(guó)產(chǎn)品牌Biog在檢測(cè)敏感性、操作簡(jiǎn)便性、儀器兼容性以及價(jià)格上占有很大優(yōu)勢(shì),進(jìn)口品牌Q在核酸純度、操作簡(jiǎn)便性上有一定優(yōu)勢(shì),國(guó)產(chǎn)品牌T在DNA得率、儀器兼容性上也有一定優(yōu)勢(shì)。我們需要將產(chǎn)品性能和產(chǎn)品價(jià)格綜合考慮,選擇一款真正適合我們實(shí)驗(yàn)的試劑盒。以上只是我個(gè)人的一些看法,僅供參考,謝謝。