腫瘤異質(zhì)性的背景知識

腫瘤異質(zhì)性定義:

腫瘤的異質(zhì)性是惡性腫瘤的特征之一,是指腫瘤在生長過程中,經(jīng)過多次分裂增殖,其子細(xì)胞呈現(xiàn)出分子生物學(xué)或基因方面的改變,從而使腫瘤的生長速度、侵襲能力、對藥物的敏感性、預(yù)后等各方面產(chǎn)生差異。

腫瘤的2個主要模型

1、腫瘤干細(xì)胞模型:腫瘤干細(xì)胞由干細(xì)胞癌變或分化的細(xì)胞脫分化后產(chǎn)生,具有自我更新和繁殖的能力,被認(rèn)為在癌癥復(fù)發(fā)中具有重要作用。

2、克隆進(jìn)化模型

1)選擇性進(jìn)化:一部分腫瘤克隆具有選擇性優(yōu)勢,驅(qū)動突變積累。

2)大爆炸模型:腫瘤由一些早期的亞克隆擴(kuò)增而成,沒有后期的選擇。

3)中性進(jìn)化:腫瘤中原本積累了一些關(guān)鍵的基因組變異(driver mutation),擴(kuò)增由單個關(guān)鍵基因組事件引發(fā),隨后中性進(jìn)化,在亞克隆中產(chǎn)生大量新突變(passenger mutation)。即,克隆選擇發(fā)生在腫瘤生長之前。

4)分支進(jìn)化模型:腫瘤細(xì)胞源于一個共同的祖先,平行進(jìn)化。

翻譯:
2018-Computational approaches for inferring tumor evolution from single-cell genomic data 根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫推斷腫瘤進(jìn)化的一種計算方法
摘要
腫瘤中的基因組異質(zhì)性是由突變,高適應(yīng)性單細(xì)胞的選擇以及進(jìn)化的操作成分造成的。精確了解腫瘤的突變異質(zhì)性和進(jìn)化軌跡,可以為預(yù)測癌癥進(jìn)展和設(shè)計個性化治療提供有用的見解。快速發(fā)展的單細(xì)胞基因組學(xué)領(lǐng)域提供了一個研究腫瘤異質(zhì)性和最終解決水平進(jìn)化的機(jī)會。在這篇綜述中,我們概述了人工單細(xì)胞DNA測序方法的現(xiàn)狀、由此產(chǎn)生的大規(guī)模數(shù)據(jù)集固有的技術(shù)錯誤以及克服這些錯誤的計算方法。最后,我們討論了在單個細(xì)胞解決中理解腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和腫瘤演變的計算和數(shù)學(xué)方法。
關(guān)鍵詞:單細(xì)胞,基因組學(xué),DNA測序,變量檢測,系統(tǒng)發(fā)育學(xué),腫瘤內(nèi)異質(zhì)性,腫瘤演化
引言:癌癥是一種從存在于身體組織中的單個細(xì)胞中產(chǎn)生的疾病。由復(fù)雜的體細(xì)胞突變的相互作用、拷貝數(shù)改變(CNAS)和染色體重排驅(qū)動。


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