2022.8.17 R包.png
R包
1 安裝和加載
- CRAN鏡像是R默認(rèn)使用的R包倉庫，install.packages()只能用于安裝發(fā)布在CRAN上的包。
- Bioconductor是基因組數(shù)據(jù)分析相關(guān)的軟件包倉庫。
- 一次性配置好鏡像源
（1）file.edit('~/.Rprofile')
（2）保存——直接使用即可image.png -
install.packages(“包”)R包安裝 -
BiocManager::install(“包”)Biocductor安裝 - 調(diào)用：
library(包)require(包)
eg：dplyr包：數(shù)據(jù)分析包
dplyr五個(gè)基礎(chǔ)函數(shù)
test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
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-
mutate(test, *new* =*A+B*)新增列
image.png -
select(test,*1*)篩選列
image.png - 篩選行：
filter(test, Species == "setosa")
filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))image.png -
arrange(test, Sepal.Length)按某1列或某幾列對整個(gè)表格進(jìn)行排序
image.png -
summarise()匯總
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dplyr兩個(gè)實(shí)用技能
1 %>% 管道操作 (cmd/ctr + shift + M)將上一個(gè)函數(shù)結(jié)果作為下一個(gè)函數(shù)的第一個(gè)參數(shù)
2 count(test,Species)統(tǒng)計(jì)某列的unique值
dplyr處理關(guān)系數(shù)據(jù)
eg：
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1 inner_join(test1, test2, by = "x")內(nèi)連inner_join,取交集（test1和2均有“x”，所以等值連接把兩張表里x相同的連接起來）
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2 left_join(test1, test2, by = 'x')左連left_join（test1的左為左，test2右為右，保留test1左側(cè)x所有，對應(yīng)test2補(bǔ)上，沒有的天NA）
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3 full_join( test1, test2, by = 'x')全連full_join
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4 semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')半連接：返回能夠與y表匹配的x表所有記錄semi_join
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5 anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')反連接：返回?zé)o法與y表匹配的x表的所記錄anti_join
6 簡單合并：bind_rows(test1, test2)兩個(gè)表格列數(shù)相同；
bind_cols(test1, test3)兩個(gè)數(shù)據(jù)框有相同的行數(shù)
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