第六學習小組day5-gl

變量

  • 變量分為向量和標量


    image.png
  • 賦值

x<-c(1,2,3) #常用的向量定義寫法,意為將x定義為由元素1,2,3組成的向量。
x<-(1:10) #從1-10之間所有的整數
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之間每隔0.5取一個數(注意這里是逗號不是分號)
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重復2次

數據框

  • 獲得示例數據
    X<-read.csv('doudou.txt')
  • 讀取本地數據

read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #讀取文件,分隔符為Tab,有表頭
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把這個數據框賦給一個變量a

  • 設置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數據里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個數據框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默認值的行名就是行號,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回數據,左上角第一格為空,R會自動補為x,用這個命令來修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名

  • 數據框的導出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)

  • 變量的保存與重新加載

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當前所有變量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一個變量
load("frame1.RData")#再次使用RData時的加載命令

注意frame1是變量名,如此次應該輸入X

  • 提取元素

X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列(橫著寫,這是不夠懶也不夠優(yōu)秀卻能存在的寫法)
X[y] #第y列(豎著寫,這是懶惰又優(yōu)秀的寫法)
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列(優(yōu)秀寫法,而且這個命令還優(yōu)秀到不用寫括號的地步,并且支持Tab自動補全哦,不過只能提取一列)
教程里小結說,(這里的X是指的我用過的一個變量名,實際應用要懂得替換。剛才讓師姐測試我教程的時候很擔憂你們粗暴地復制我的代碼,最后啥也沒看懂。) 這次我輸入的上面用到的X,不知道小潔說替換的意思,是不是如果變量是Y,則此處輸入Y

  • 直接使用數據框中的變量
    attach 和 with


    image.png

今天操作上沒有大的問題,只是最后保存腳本沒有順利進行,按照教程所指位置點擊沒有反應。還有保存所有界面到Rdata文件夾看到我電腦上R后綴的不顯示,不知道是不是前段時間R安裝的不對。還有最近這幾天都在用Rstudio輸入,不知道安裝那個R有什么用。
image.png
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