ChIP-步驟關(guān)鍵點(diǎn)

1.使用fastqc進(jìn)行質(zhì)檢

主要看總體reads quality 、sequence composition 、GCbias 、Adaptor pollution

2.比對之后得到的sam文件（TEXT.file）BAM文件是壓縮后的并且含有index的格式文件

3.使用IGV進(jìn)行可視化

4.peak數(shù)目取決于callpeak使用方法以及卡的閾值。reads越多并不意味著更多的peaks。 不同的方法可能會(huì)的到60-80相似的peaks

5.對于轉(zhuǎn)錄因子，6-10million reads is minimum且足夠的 、15-20 millionis是組蛋白修飾

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