文章信息
文章標(biāo)題：Expression profiles of microRNA-mRNA and their potential impact on anthocyanin accumulation in purple petals of Brassica napus
文章主題：miRNA-mRNA的表達(dá)譜及其對(duì)油菜紫花花瓣花青素積累的潛在影響
發(fā)表期刊：BMC Plant Biology
影響因子：4.8
合作單位：贛南師范大學(xué)陳道宗+譚晨研究團(tuán)隊(duì)
組學(xué)技術(shù)：mRNA-seq、miRNA-seq
研究背景
油菜（Brassica napus L.）作為油料作物、蔬菜作物和飼料作物具有顯著的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，同時(shí)兼具優(yōu)良的觀賞特性。近年來(lái)，花色育種技術(shù)的突破顯著提升了油菜的視覺(jué)吸引力，其中花青素被確認(rèn)為紅、紫、粉三色花朵形成的主要調(diào)控因子。然而，油菜花瓣著色過(guò)程中花青素合成與調(diào)控的分子機(jī)制仍不明確。
研究思路
研究結(jié)論
本研究通過(guò)整合四個(gè)不同花色階段的miRNA與mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)及降解組分析，揭示了調(diào)控紫花油菜花青素積累的關(guān)鍵miRNA-mRNA模塊。在花瓣發(fā)育過(guò)程中，共檢測(cè)到247個(gè)miRNA（包括223個(gè)已知miRNA和24個(gè)新發(fā)現(xiàn)miRNA），其中64個(gè)呈現(xiàn)差異表達(dá)模式。通過(guò)降解組測(cè)序?qū)?52個(gè)差異表達(dá)miRNA的靶標(biāo)進(jìn)行系統(tǒng)分析，發(fā)現(xiàn)108個(gè)miRNA-mRNA模塊存在差異表達(dá)特征。此外還鑒定出若干miRNA及其靶標(biāo)，可能參與調(diào)控紫花油菜花青素的積累。由miR156b和miR828組成的調(diào)控模塊miR156-SPL9與miR828-PAP2及其靶標(biāo)，可能在該過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。該研究結(jié)果對(duì)與油菜（B. napus）花青素調(diào)控相關(guān)的miRNA進(jìn)行了全面分析，為理解十字花科作物中miRNA介導(dǎo)的花青素生成調(diào)控機(jī)制提供了重要依據(jù)。
