2020-02-12 Day 25 用CIBERSORT分析腫瘤浸潤的免疫細(xì)胞(附代碼)

因?yàn)樵诰W(wǎng)上看了一些視頻,然后用數(shù)據(jù)試了一下,發(fā)現(xiàn)一直在運(yùn)行,打開代碼一看,發(fā)現(xiàn)是我看不懂的,也不知道哪錯了,在網(wǎng)上搜了半天,不是要錢就是故意給你改錯的,網(wǎng)頁版的注冊還不成功,換成英文搜了一遍,發(fā)現(xiàn)還是外國人好,現(xiàn)在分享給大家學(xué)習(xí)一下。

PubMed

PubMed上有一篇文章,專門介紹了CIBERSORT的使用說明


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我們使用的時候,安裝好需要的包,然后將文件和CIBERSORT.R放到同一個目錄下,運(yùn)行下面的語句


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CIBERSORT.R

這個是在https://rdrr.io/github/singha53/amritr/src/R/supportFunc_cibersort.R
這個網(wǎng)站上的,直接復(fù)制另存為CIBERSORT.R,打不開的可以看下圖

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