Day7-hongh

測序知識

測序過程和原理

一代測序

  • 雙脫氧終止反應(yīng)法:ddNTP,3‘端無羥基

二代測序

  • 構(gòu)建文庫
  • 橋式PCR
  • 測序
  • 讀取index/barcode
  • 雙向測序

三代測序

  • 納米孔測序,SMRT技術(shù)

都有哪些類型的測序

基因組學(xué)(核酸序列分析)

  1. 全基因組測序(WGS)
  2. 全外顯子組測序(WES)
  3. 簡化基因組測序(RRGS)
    • RAD-Seq
    • GBS
    • 2bRAD
    • ddGBS(也就是ddRAD)

轉(zhuǎn)錄組學(xué)(基因表達分析)

  1. mRNA-Seq
  2. IncRNA-Seq(長鏈非編碼RNA)
  3. sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)

蛋白質(zhì)組學(xué)

  1. 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)處理、蛋白及其修飾鑒定
  2. 構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、相關(guān)軟件的開發(fā)和應(yīng)用
  3. 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能預(yù)測
  4. 蛋白質(zhì)連鎖圖

代謝組學(xué)

  1. 代謝物指紋分析
  2. 代謝輪廓分析


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