1.轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)概念：廣義的轉(zhuǎn)錄組指特定發(fā)育階段或生理?xiàng)l件下從一種細(xì)胞或組織的基因組所轉(zhuǎn)錄出的RNA的總和，包括編碼蛋白質(zhì)的mRNA和各種非編碼RNA(ncRNA)，如rRNA、tRNA、核仁小RNA(snoRNA)、小核RNA(snRNA)、微RNA(mRNA)和其他ncRNA等。
2.轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要目標(biāo):? catalogue all species of transcript, including mRNAs, non-coding RNAs and small RNAs
3.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（RNA-seq）：利用高通量測(cè)序技術(shù)將細(xì)胞或組織中全部或部分mRNA、small RNA和no-codingRNA 進(jìn)行測(cè)序分析的技術(shù)。
原理：長(zhǎng)RNA首先通過RNA片斷或DNA片斷轉(zhuǎn)換成cDNA片斷文庫。隨后將測(cè)序接頭(藍(lán)色)添加到每個(gè)cDNA片段，并使用高通量測(cè)序技術(shù)從每個(gè)cDNA獲得短序列。將得到的序列讀數(shù)與參考基因組或轉(zhuǎn)錄組比對(duì)，并將其分為三種類型：exonic reads、junction reads、poly(A) end reads
4.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理
4.1原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
4.2reads比對(duì)
4.3轉(zhuǎn)錄本組裝
4.4轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)
4.5轉(zhuǎn)錄本表達(dá)水平分析
4.6變異檢測(cè)
參考文獻(xiàn)
Wang Z , Gerstein M , Snyder M . RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics.[J]. Nature reviews. Genetics, 2009, 10(1):57.
崔凱, 吳偉偉與刁其玉, 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的研究和應(yīng)用進(jìn)展. 生物技術(shù)通報(bào), 2019. 35(07): 第1-9頁.
