我們將從數(shù)據(jù)的維度,討論現(xiàn)代醫(yī)學(xué)發(fā)展最底層的工作是多么重要和冗雜。
2020-4-20前,由OHDSI官方翻譯《The Book of OHDSI》中關(guān)于醫(yī)學(xué)統(tǒng)計分析的內(nèi)容,并補(bǔ)充對應(yīng)統(tǒng)計學(xué)基礎(chǔ)知識(包括機(jī)器學(xué)習(xí))、概率論、流行病學(xué)知識,讓相應(yīng)統(tǒng)計分析方法更加容易被國內(nèi)公眾理解,降低使用門檻
2020-4-20前,在不保證翻譯質(zhì)量的情況下,盡量保持和《The Book of OHDSI》最新內(nèi)容同步的中文翻譯內(nèi)容,并建立行之有效的志愿協(xié)作網(wǎng)絡(luò),維持非官方版《OHDSI中文書》的更新,沉淀公眾對于《The Book of OHDSI》的文章段落的評論、討論、參考內(nèi)容等”筆記“知識,降低公眾對于OHDSI相關(guān)工作的理解門檻。
2020年4月24日前,針對國內(nèi)醫(yī)院數(shù)據(jù)庫向CDM轉(zhuǎn)換的工作進(jìn)行討論和文檔優(yōu)化,讓數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換工作更加容易被國內(nèi)公眾理解,降低實施門檻
2020-5-10前,對OMOP的醫(yī)療標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(CDM)進(jìn)行討論和文檔優(yōu)化,讓CDM更加容易被國內(nèi)公眾理解,降低使用門檻
2020-4-24 開始,將文章(成品或半成品)不分任何渠道/媒體形式,普及、推廣給大眾
2020-8-05 評判是否需要更改”協(xié)作網(wǎng)絡(luò)運行機(jī)制“為備選方案
OHDSI標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)模型(OMOP CDM)系列文章
Overview
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)模型就是一張一張表,其中有系統(tǒng)所使用的常用詞典等數(shù)據(jù),也有居民健康真實世界數(shù)據(jù),我們這個系列就介紹OHDSI的CDM中,是如何存儲這些真實世界數(shù)據(jù)的,以方便我們以后去理解如何使用這些數(shù)據(jù),通過統(tǒng)計學(xué)習(xí)的方法,將基礎(chǔ)數(shù)據(jù)信息轉(zhuǎn)化為知識,以轉(zhuǎn)化為現(xiàn)實世界的決策輔助方案。
這些表包含每個居民在有效觀察期內(nèi),時間縱向發(fā)生的臨床事件的重要信息,以及該居民的人口統(tǒng)計信息。下面的實體關(guān)系圖,突出顯示了CDM中的標(biāo)準(zhǔn)化臨床數(shù)據(jù)部分的表:
These tables contain the core information about the clinical events that occurred longitudinally during valid Observation Periods for each Person, as well as demographic information for the Person.
Below provides an entity-relationship diagram highlighting the tables within the Standardized Clinical Data portion of the OMOP Common Data Model:

本系列在介紹目前世界上最適用于臨床科研+衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)格式(未經(jīng)嚴(yán)謹(jǐn)考證,但有相關(guān)研究發(fā)表在專業(yè)期刊上),儼然是真實世界研究方案里面最接進(jìn)成熟的基礎(chǔ)建設(shè)方案。感興趣的介紹請移步B站觀看視頻。
OHDSI——觀察性健康醫(yī)療數(shù)據(jù)科學(xué)與信息學(xué),是一個世界性的公益型非盈利研究聯(lián)盟,主要研究全方位醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析的開源解決方案,旨在通過大規(guī)模數(shù)據(jù)分析和挖掘來提升臨床醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)價值,實現(xiàn)跨學(xué)科、跨行業(yè)的多方合作。目前,目前,已有來自美國、加拿大、澳大利亞、英國等幾十個國家地區(qū)的上百個組織機(jī)構(gòu),高校,醫(yī)院和公司企業(yè)參與了OHDSI全球協(xié)作網(wǎng)絡(luò),如斯坦福、哈佛、杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院,強(qiáng)生、諾華、甲骨文、IBM公司,擁有超過6億人口的臨床數(shù)據(jù)規(guī)模,累計協(xié)作研究發(fā)表了上百篇論文。
我們在這里邀請國內(nèi)對相關(guān)工作感興趣、愿共同學(xué)習(xí)的好學(xué)人士參與到中文興趣小組,互通有無,一起彌補(bǔ)跨行業(yè)、跨學(xué)科的知識積累。前期主要以對OHDSI在github上的開源工作進(jìn)行翻譯、交流、學(xué)習(xí)為主,并會對醫(yī)療大數(shù)據(jù)、醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué)、生物信息學(xué)等學(xué)科知識建立學(xué)習(xí)互助、互督的機(jī)制。有興趣的請看文檔,微信群二維碼在內(nèi):OHDSI中文興趣小組共識&OHDSI介紹
OHDSI秉持開源、開放的宗旨,加快全球醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)研究的步伐,本文內(nèi)容原創(chuàng)來自Github(https://github.com/OHDSI/CommonDataModel/wiki),若有利益沖突,請在本頁面留言,真-侵刪。