一、介紹

1.BioCyc

BioCyc是代謝途徑的數(shù)據(jù)庫集合，集合中的每個數(shù)據(jù)庫描述了單個生物體的基因組和代謝途徑（MetaCyc是來自代謝途徑的參考來源），包括反應(yīng)、酶、基因和底物化合物。第一層數(shù)據(jù)庫包含EcoCyc、MetaCyc和BOCD，第二層和第三層數(shù)據(jù)庫則包含了計算預(yù)測代謝通路，以及哪些基因編碼代謝通路中缺少酶的預(yù)測和預(yù)測的操縱子。BioCyc提供的分析工具包括：基因組瀏覽器、個體代謝通路和完整代謝圖的顯示等。
【https://humancyc.org/publications.shtml#】
【http://metacyc.ai.sri.com/PToolsWebsiteHowto.shtml#SearchHelp】

2.MetaCyc

MetaCyc數(shù)據(jù)來源科學(xué)實驗文獻，為代謝通路和酶提供了大量的參考信息，含有初生代謝和次生代謝通路，還包括相關(guān)的化合物、酶和基因。Metacyc是一個多有機體數(shù)據(jù)庫，其他生物數(shù)據(jù)庫描述單個生物體的代謝網(wǎng)絡(luò)和基因組，并將實驗確定的路徑與計算預(yù)測的路徑混合。Metacyc僅包含實驗闡明的途徑。
MetaCyc的應(yīng)用：查詢代謝通路、預(yù)測基因組測序中的代謝通路、通過酶數(shù)據(jù)庫支持代謝通路。

二、使用

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參考：
1.國基還未中？你與國基之間可能就差這么幾個數(shù)據(jù)庫??！