BioStar handbook生信入門

? ? ? 剛剛從本科生步入研究生階段,本科是211的純生物狗,對于實(shí)驗(yàn)技能和生物知識(shí)理解還算可以,現(xiàn)在在985學(xué)校讀研究生,剛剛開始研究生生活三個(gè)多月,從純實(shí)驗(yàn)操作到依靠計(jì)算機(jī)為基礎(chǔ)進(jìn)行研究,對于我有較大的轉(zhuǎn)變,步入生信領(lǐng)域其實(shí)是我開心的事情,其一是我對計(jì)算機(jī)很感興趣,其二就是生物學(xué)基礎(chǔ)吧,還有較好的發(fā)展。

? ? ? 這樣子在網(wǎng)絡(luò)上暢聊還是第一次,所以寫這篇文章發(fā)表在小組內(nèi)也猶豫了很久,平時(shí)許多事情大多通過自學(xué)等途徑,當(dāng)然這樣效率蠻低。希望不要嫌棄我的啰嗦,哈哈。

? ? ? 下面開始正文,接觸生信三個(gè)月來,從完全的小白到現(xiàn)在的接觸皮毛,距離我想要的還有很大一段路要走。

? ? ? 目前基本了解和接觸的內(nèi)容:

1. 數(shù)據(jù)庫:NCBI? UCSC? GenBank等會(huì)簡單的運(yùn)用,閱讀完一本生信教材,對轉(zhuǎn)錄和DNA,蛋白質(zhì),基因等有了初步的數(shù)據(jù)理解,了解基本的BLAST和FASTA內(nèi)容。

2.編程工具:R和Python完成了初步的認(rèn)識(shí),但是實(shí)例做的很少,代碼敲的很少。希望接下來加大使用頻率,盡快熟練掌握。

3.實(shí)驗(yàn)室這學(xué)期要完善服務(wù)器和網(wǎng)站,所以在學(xué)習(xí)Typo3 Script編寫網(wǎng)站,但是代碼階段還沒進(jìn)行,Html知識(shí)和PHP內(nèi)容也需要但還沒有學(xué)習(xí)。還有服務(wù)器構(gòu)建也不會(huì),但想學(xué)習(xí)。

4.基于研究內(nèi)容,真核生物復(fù)制起始點(diǎn)相關(guān),所以要通過機(jī)器學(xué)習(xí)和相關(guān)算法進(jìn)行研究,也沒有進(jìn)行。

5.生信領(lǐng)域的算法和研究思路,還有使用工具等了解也很少,總的來說,內(nèi)容很多,比如RNA-seq和Chip-seq,biostar,全基因組分析,高通量測序,幾代測序方法等,都只是聽過但都不了解,而且覺得還有許多沒聽過的內(nèi)容。對于這樣雜的小內(nèi)容平時(shí)要多收集和整理。

6.文獻(xiàn)方面,最近在閱讀文獻(xiàn),由于讀的比較少可能,許多單詞不認(rèn)識(shí),一篇文章一兩頁可能就要閱讀一晚上,但是現(xiàn)在有記錄文獻(xiàn)總結(jié)的習(xí)慣。

7.從公眾號(hào)和其他平臺(tái)得到了一些視頻和書籍資料,看視頻但是不太基礎(chǔ),目前聽不太懂,實(shí)例的研究思路不到位。

8.之后想要通過編寫完成一個(gè)數(shù)據(jù)庫的建立,所以還要學(xué)習(xí)C++和java的內(nèi)容,但是可能要擱置較久了。

? ? ? 截止今天,嘗試開始在幕布上寫一些自己的心得和生信學(xué)習(xí)過程,新人上路,多謝這三個(gè)月來老師和各位同學(xué),博主等的幫助,蟹蟹這個(gè)平臺(tái)讓我有勇氣開始記錄自己的成長~~東西太多,話有點(diǎn)多,請多擔(dān)當(dāng)。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容