一個(gè)基因/樣品如何畫熱圖呢?

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在科研數(shù)據(jù)分析中,我們往往是抽絲剝繭,希望找到幾個(gè),最好就是一個(gè)關(guān)鍵基因,比如我們想找易感基因、驅(qū)動(dòng)基因、Marker基因等。當(dāng)然功夫不負(fù)有心人,最終我們都可能如愿以償!但后續(xù)如何把結(jié)果呈現(xiàn)出來(lái),卻要不知所措了:一個(gè)基因的數(shù)據(jù)該如何可視化?可以畫熱圖嗎?

一般的情況,我們畫出來(lái)的圖是這樣的:

圖1 普通熱圖

如何完善上面的圖呢?首先我想到的兩個(gè)思路是,1. 把熱圖掰彎變成環(huán)形熱圖;2. 調(diào)整熱圖的圖例及比例構(gòu)成。那么如何實(shí)現(xiàn)呢? 接下來(lái)我們可以通過“派森諾基因云(https://www.genescloud.cn)”的“交互原值熱圖”進(jìn)行實(shí)現(xiàn)。

1 準(zhǔn)備數(shù)據(jù)

準(zhǔn)備圖2, 圖3 所示數(shù)據(jù),“交互原值熱圖”工具支持兩種類型的數(shù)據(jù)。

圖2 縱向數(shù)據(jù)
圖3 橫向數(shù)據(jù)

2 提交繪圖

上傳數(shù)據(jù)后,一鍵提交繪圖。

圖4 提交數(shù)據(jù)繪圖

3 參數(shù)調(diào)整

在圖表調(diào)整里面,選擇【圖表設(shè)置→圖表類型→圓形圖】,除了對(duì)圖表類型外,還可以對(duì)圖表的顏色及圖例等樣式進(jìn)行設(shè)置。

圖5 選擇圓形圖

不同的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),得到的圖也不一樣,如下所示:

圖6 縱向數(shù)據(jù)結(jié)果圖
圖7 橫向數(shù)據(jù)結(jié)果圖

如果對(duì)上述圖還有更加個(gè)性化的要求,大家可以下載pdf或者svg格式的圖片,導(dǎo)入AI軟件進(jìn)行處理,比如調(diào)整字體、圖例位置等。下面給大家分享一個(gè)圖形換色的功能。點(diǎn)擊AI軟件【編輯→編輯顏色→重新著色圖稿】,可以根據(jù)需要選擇互補(bǔ)色、近似色等智能推薦方案,也可以自定義更改目前的顏色。

圖8 編輯顏色
圖9 編輯顏色面板
圖10 調(diào)色后示例
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