fMRI的分析結(jié)果怎么提取信息?用xjview

一、下載和安裝 xjview

(1)在官網(wǎng)下載 xjview 安裝包,填寫郵箱,會(huì)收到下載鏈接(http://www.alivelearn.net/xjview/download/);
(2)解壓后將 xjview 文件夾添加到 MATLAB 搜索路徑;
(3)將 xjview 文件夾中的 aal.img/hdr, brodman.img/hdr, ch2.img/hdr 和 ch2bet.img/hdr 復(fù)制到 SPM 安裝目錄下的 canonical 文件夾下;
(4) 在 MATLAB 命令行窗口輸入 xjview 測(cè)試是否安裝成功。

二、四種呈現(xiàn)方式

xjview 有四種呈現(xiàn)腦圖的方式,分別為 glass, section, 3D render 和 slice 視圖。
(1)點(diǎn)擊“Or click to open an example image”, 打開(kāi) xjview 提供的一個(gè)樣例數(shù)據(jù);

(2)打開(kāi)樣例數(shù)據(jù)后,會(huì)在更新的窗口中呈現(xiàn)兩種腦圖,左邊的是 glass 視圖,右邊的是 section 視圖;
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(3)點(diǎn)擊窗口左下角中的“Render View”會(huì)彈出 3D 視圖的窗口;
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(4)點(diǎn)擊窗口左下角中的“slice view”會(huì)彈出 slice 視圖的窗口。


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三、定位腦區(qū)

(1)在 section 視圖中選擇一個(gè)位置,在 glass/section 視圖正下方會(huì)出現(xiàn)該位置的定位信息。通過(guò)//分隔,前 5 個(gè)是基于 Talairach 分區(qū)模板,第 6 個(gè)是基于 AAL 分區(qū)模板。


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(2)點(diǎn)擊左下角中的“Pick Cluster/Info”會(huì)在窗口中顯示該位置所屬團(tuán)塊(cluster)的大小(體素個(gè) 數(shù))和腦區(qū)信息。


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(3)點(diǎn)擊左下角中的“Report”會(huì)在命令行窗口中顯示所有團(tuán)塊的大小、腦區(qū)、定點(diǎn)坐標(biāo)、極大值等信 息。
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(4)點(diǎn)擊左下角的“Volume”會(huì)顯示所有團(tuán)塊的信息,點(diǎn)擊某個(gè)團(tuán)塊的坐標(biāo),section 視圖中的光標(biāo)會(huì) 自動(dòng)跳到該坐標(biāo)的位置,即可以通過(guò)交互的方式查看團(tuán)塊。


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四、同時(shí)顯示多個(gè)文件

(1)打開(kāi)文件時(shí),同時(shí)選擇多個(gè)文件即可實(shí)現(xiàn)多個(gè)文件重疊顯示的效果。
(2)點(diǎn)擊左下角“common region”,只顯示多個(gè)文件重疊(共有)的區(qū)域。


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五、其他

(1)去除 slice 視圖的光標(biāo)(xhair)


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(2)設(shè)置顏色(colorbar)
可以通過(guò)調(diào)整 colorbar 的最大&最小值的方式來(lái)設(shè)置顏色。

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(3)可以只顯示正或負(fù)值
(4)調(diào)整顯示的閾值
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參考:http://learning-archive.org/?p=184

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