zmCCT9增強(qiáng)了玉米的向高緯度的適應(yīng)性啊

1摘要部分

起初，大芻草進(jìn)化而來(lái)的玉米是短日照，在短日條件下開(kāi)花，長(zhǎng)日照條件下花期推遲甚至不開(kāi)花。通過(guò)定位克隆和關(guān)聯(lián)定位，將一個(gè)花期數(shù)量性狀位點(diǎn)確定位于CCT轉(zhuǎn)錄因子(ZmCCT9)上游57 kb的（Harbinger-like）的轉(zhuǎn)座元件。Harbinger-like元件順式抑制ZmCCT9表達(dá)，促進(jìn)長(zhǎng)日照開(kāi)花。CRISPR/Cas9敲除ZmCCT9會(huì)導(dǎo)致長(zhǎng)時(shí)間開(kāi)花提前。ZmCCT9受晝夜調(diào)控，負(fù)向調(diào)控成花原基因ZCN8的表達(dá)，從而導(dǎo)致在長(zhǎng)日照條件下開(kāi)花時(shí)間較晚。?群體遺傳學(xué)分析表明，Zmcct9上的harbinger樣轉(zhuǎn)座子插入和另一個(gè)CCT平行序列ZmCCT10上的caca樣轉(zhuǎn)座子插入在馴化后依次出現(xiàn)，并且是玉米適應(yīng)高緯度的選擇目標(biāo)。我們的發(fā)現(xiàn)有助于解釋在前哥倫布時(shí)代，具有豐富轉(zhuǎn)座子活性的動(dòng)態(tài)玉米基因組如何使玉米適應(yīng)超過(guò)90°的緯度

總結(jié)CCT9和10上面的轉(zhuǎn)座子插入降低玉米對(duì)于短日照的敏感性

F1-1鎖定區(qū)間

利用866個(gè)大群體的玉米-大芻草BC 2 s3重組自交系(RILs)，在長(zhǎng)日照條件下進(jìn)行了開(kāi)花天數(shù)的QTL定位(27)。然后精細(xì)定位，確定在2.4kb的位置，同時(shí)這2.4kb為非編碼區(qū)。

分離出NIL系

在自然長(zhǎng)日照條件下的田間測(cè)試表明，NIL(玉米)比NIL(大芻草)早大約4天開(kāi)花(圖1 d - f)，同時(shí)植株高度和葉數(shù)也較低(SI附錄，圖S2)。然而，短日照條件下，這些差異不顯著。表明qDTA9受光周期調(diào)控。

關(guān)聯(lián)分析找到TE

CCT9和CCT10分別在chr9和chr10，所以命名9-10.關(guān)聯(lián)分析確定變異位點(diǎn)TE（qtl）與TE24k下游ZmCCT9基因。

這個(gè)部分就是常規(guī)驗(yàn)證CCT9是否作用花期

表達(dá)情況分析

zmct9是受晝夜調(diào)控的，玉米等位基因的光周期敏感性比大芻草等位基因低得多，這可能是由于qDTA9 2.4 kb致病區(qū)域的Harbinger-like元件的抑制作用

TE抑制表達(dá)

進(jìn)化分析

首先，發(fā)現(xiàn)73個(gè)大芻草祖先群體中都沒(méi)有這個(gè)TE，然后分別看了有TE的玉米自交系，無(wú)TE的玉米自交系，以及大芻草三個(gè)大群中核苷酸多態(tài)性的比例，發(fā)現(xiàn)大芻草中多態(tài)性最多，無(wú)TE群眾多態(tài)性其次，而又TE玉米群眾多態(tài)性最低。

后面基本都是一樣的東西