circad:環(huán)狀RNA疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫

歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”!

環(huán)狀RNA具有重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能,越來越多的研究表明,環(huán)狀RNA在許多疾病的發(fā)生與發(fā)展中扮演重要角色,circad是一個(gè)疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA數(shù)據(jù)庫,網(wǎng)址如下

http://clingen.igib.res.in/circad/

該數(shù)據(jù)庫中,共收錄了122種疾病和相關(guān)的1000個(gè)環(huán)狀RNA,包含了618個(gè)基因,是目前最為全面的疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA數(shù)據(jù)庫。

對(duì)于每種疾病,提供了國際疾病分類系統(tǒng)ICD-10對(duì)應(yīng)的編碼,來唯一標(biāo)識(shí),同時(shí)還提供了對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn),方便研究者查閱和參考。

官網(wǎng)提供了以下多種檢索方式

  1. circRNA Name

  2. Gene

  3. Locus

  4. Organism

  5. Disease

  6. ICD-10

以乳腺癌為例,對(duì)應(yīng)的ICD-10的編碼為C50,檢索結(jié)果如下所示

第一列是環(huán)狀RNA的名字,第二列是別名,第三列是環(huán)狀RNA來源基因的名字,第四列為環(huán)狀RNA的基因組位置,第五列為物種,第六列為疾病對(duì)應(yīng)的ICD-10編碼,第七列為疾病的名稱。

點(diǎn)擊環(huán)狀RNA的名字,可以查看詳細(xì)信息,結(jié)果示意如下

會(huì)給出對(duì)應(yīng)的檢測(cè)方法,參考文獻(xiàn),以及在患病者中的表達(dá)趨勢(shì)。

目前數(shù)據(jù)庫對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)還沒有正式發(fā)表,發(fā)表之后這數(shù)據(jù)庫就會(huì)公開下載鏈接。


·end·

—如果喜歡,快分享給你的朋友們吧—


掃描關(guān)注微信號(hào),更多精彩內(nèi)容等著你!


?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容