2022-11-28_AS rmats2sashimiplot github install

rmats2sashimiplot的github
https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot

git clone https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot.git
cd rmats2sashimiplot

因?yàn)槲业膒ython不是2.7的,所以提前需要運(yùn)行


bash  2to3.sh
python ./setup.py install
rmats2sashimiplot
16:22:59 jiarongf@222.197.214.27:/data1/jiarongf/software/rmats2sashimiplot
$
rmats2sashimiplot
usage: rmats2sashimiplot [-h] -o OUT_DIR [--l1 L1] [--l2 L2]
                         [-t {SE,A5SS,A3SS,MXE,RI}] [-e EVENTS_FILE]
                         [-c COORDINATE] [--s1 S1] [--s2 S2] [--b1 B1]
                         [--b2 B2] [--exon_s EXON_S] [--intron_s INTRON_S]
                         [--group-info GROUP_INFO] [--min-counts MIN_COUNTS]
                         [--color COLOR] [--font-size FONT_SIZE]
                         [--fig-height FIG_HEIGHT] [--fig-width FIG_WIDTH]
                         [--hide-number] [--no-text-background]
                         [--keep-event-chr-prefix] [--remove-event-chr-prefix]
rmats2sashimiplot: error: the following arguments are required: -o

這樣就安裝好了

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容