#如果要想做一個(gè)分析的話，至少要預(yù)留30倍以上的空間。

#學(xué)會(huì)編程解決大量重復(fù)工作可以極大提高工作效率

#數(shù)據(jù)分析的基本思想：大數(shù)據(jù)（序列）→大表（特征表）→小表（統(tǒng)計(jì)表）→圖

#shell——《鳥哥的私房菜》，R-ggplot2——《數(shù)據(jù)分析與圖片藝術(shù)》

#Mothur/Usearch（需購買）/Vsearch（Usearch的免費(fèi)版）/QIIME2流程——從頭到尾分析擴(kuò)增子

#可視化的常用R包：vegan，phyloseq，microbiome

vegan在多樣性分析和環(huán)境因子的關(guān)聯(lián)上有很多非常成熟的函數(shù)和體系； phyloseq把進(jìn)化樹的信息整合進(jìn)來了，可以做比較漂亮的關(guān)于進(jìn)化的探討和一些美化；microbiome包跟多組學(xué)關(guān)聯(lián)還有跟表型的關(guān)聯(lián)上，有一些自定義的函數(shù)可以使用。

#很多文章會(huì)再Github上提供作圖代碼，用那些現(xiàn)成代碼改改，應(yīng)用到自己的課題上，可以節(jié)約大量的時(shí)間。

#ImageGP——在線繪制20種圖

#mageGP，提供R語言在線繪制，20多種常見的圖，

參考：https://mp.weixin.qq.com/s/13f9sEPY4pEE2dimbTjPvA

Jeffery L. Dangl 和 Paul Schulze-Lefert，他們的文章不僅上傳數(shù)據(jù)規(guī)范，而且分析代碼可打包下載，是不可多得的優(yōu)秀學(xué)術(shù)材料，重現(xiàn)高水平文章結(jié)果，對自己的分析、理解能力提高是非常顯著的。