? ? ? ? ?稻瘟病菌(Pyricularia oryzae syn.Magnaporthe oryzae)能侵染水稻引致稻瘟病,每年都給世界水稻生產(chǎn)造成嚴(yán)重?fù)p失。但是稻瘟病菌群體復(fù)雜多樣,毒性變異迅速,致使一個(gè)新的水稻抗瘟品種往往種植3-5年后就失去抗性,使得該病害防控十分棘手。因此,研究明確稻瘟病菌群體遺傳多樣性特點(diǎn)及其產(chǎn)生機(jī)制十分重要,也是制定稻瘟病生態(tài)防控策略的理論基礎(chǔ)。近日,國(guó)際知名期刊The ISME Journal在線發(fā)表了福建農(nóng)林大學(xué)閩臺(tái)作物有害生物生態(tài)防控國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室王宗華研究組的研究論文“Population genomic analysis of the rice blast fungus revealsspecific events associated with expansion of three main clades”(https://www.nature.com/articles/s41396-018-0100-6)。
? ? ? ? 該研究首次利用群體基因組學(xué)的方法對(duì)來(lái)自中國(guó)和其他國(guó)家、地區(qū)的100個(gè)稻瘟病菌田間菌株全基因組SNP位點(diǎn)進(jìn)行分析,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些菌株可以劃分為3個(gè)亞群,每個(gè)亞群在世界各地均有不同程度的分布,暗示聚類結(jié)果與菌株來(lái)源地?zé)o關(guān)(圖1);但進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)這些菌株的聚類結(jié)果與其交配型密切相關(guān),其中Clade 1包含Mat 1-1和Mat1-2兩種交配型,Clade 2僅包含Mat1-2,Clade 3則僅包含Mat1-1。結(jié)果還發(fā)現(xiàn)水稻宿主不同(秈稻和粳稻)可能是導(dǎo)致Clade 2和Clade 3 群體交配型單一化的主要驅(qū)動(dòng)力。研究結(jié)果將為不同地區(qū)稻瘟病菌群體特征研究并有針對(duì)性地進(jìn)行水稻抗瘟育種和品種布局利用提供理論依據(jù)。
? ? ? ? 該研究是由福建農(nóng)林大學(xué)、臺(tái)灣大學(xué)、閩江學(xué)院和美國(guó)德州農(nóng)工大學(xué)20多位師生多年合作完成的。福建農(nóng)林大學(xué)植保學(xué)院植物病理學(xué)專業(yè)博士研究生鐘振暉、陳美蓮為共同第一作者,福建農(nóng)林大學(xué)王宗華和Justice Norvienyeku、美國(guó)德州農(nóng)工大學(xué)Daniel J. Ebbole和臺(tái)灣大學(xué)沈偉強(qiáng)教授為共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金海峽聯(lián)合基金、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目等多個(gè)項(xiàng)目的資助。