GEO(Gene Expression Omnibus database):是一個(gè)儲(chǔ)存芯片、二代測序以及其他高通量測序數(shù)據(jù)的一個(gè)數(shù)據(jù)庫。
GPL(GEO Platform):測序時(shí)使用芯片的平臺(tái)。
GSM(GEO Sample):單個(gè)樣本的數(shù)據(jù)。
GSE(GEO Series ):一個(gè)完整的研究中所使用的的全部數(shù)據(jù),包括多個(gè)GSM。

圖一
箭頭從上往下依次是:芯片平臺(tái)、樣本編號、ENA數(shù)據(jù)庫中對應(yīng)的編號(有時(shí)會(huì)還會(huì)有SRA數(shù)據(jù)庫對應(yīng)的編號)、芯片測得的原始數(shù)據(jù)。
原始數(shù)據(jù)下載解壓后如圖二

圖二