SEER數(shù)據(jù)庫(kù)臨床預(yù)測(cè)模型Nomogram列線圖繪制R語(yǔ)言如何自學(xué)?

什么是SEER:

Surveillance(監(jiān)控), Epidemiology(流行病學(xué)), End Results(最終結(jié)果)即SEER。SEER激活劃提供有關(guān)癌癥統(tǒng)計(jì)信息,以減少美國(guó)人群的癌癥負(fù)擔(dān)。SEER得到NCI癌癥控制和人口科學(xué)部(DCCPS)的監(jiān)視研究計(jì)劃(SRP)的支持。

SEER目前從覆蓋約35%的美國(guó)人口的人群癌癥登記處收集并發(fā)布癌癥發(fā)病率和生存數(shù)據(jù)。有關(guān)更多信息,SEER覆蓋率包括31.9%的白人,30.0%的非洲裔美國(guó)人,44.0%的西班牙裔美國(guó)人,49.3%的美洲印第安人和阿拉斯加土著人,57.5%的亞洲人以及68.5%的夏威夷/太平洋島民。

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SEER數(shù)據(jù)庫(kù) 臨床預(yù)測(cè)模型視頻教程

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基于SEER數(shù)據(jù)庫(kù)的臨床預(yù)測(cè)模型R語(yǔ)言教程,內(nèi)含示例文章、原始數(shù)據(jù)和R語(yǔ)言分析代碼。內(nèi)容包括:SEER數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)提取與準(zhǔn)備、K-M生存分析、Cox回歸分析、臨床預(yù)測(cè)模型構(gòu)建、Nomogram(列線圖)繪制、C-index計(jì)算、ROC曲線繪制、calibration curve(校準(zhǔn)曲線)繪制等詳細(xì)內(nèi)容。所有分析均基于R語(yǔ)言。課程內(nèi)容難易適中,適合R語(yǔ)言基礎(chǔ)薄弱甚至小白自學(xué)使用。

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SEER計(jì)劃注冊(cè)中心會(huì)定期收集有關(guān)患者人口統(tǒng)計(jì)學(xué),原發(fā)腫瘤部位,腫瘤形態(tài)和診斷時(shí),第一療程以及生命狀態(tài)隨訪方面的數(shù)據(jù)。SEER計(jì)劃是美國(guó)唯一全面的基于人群的信息來(lái)源,其中包括診斷時(shí)的癌癥分期和患者生存數(shù)據(jù)。SEER報(bào)告的死亡率數(shù)據(jù)由國(guó)家衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)中心提供。從人口普查局定期獲得用于計(jì)算癌癥發(fā)生率的人口數(shù)據(jù)。SEER數(shù)據(jù)每年更新一次,并以印刷和電子格式作為公共服務(wù)提供,有成千上萬(wàn)的研究人員,臨床醫(yī)生,公共衛(wèi)生官員,立法者,決策者,社區(qū)團(tuán)體和公眾使用SEER數(shù)據(jù)。

NCI的工作人員與北美中央癌癥登記機(jī)構(gòu)協(xié)會(huì)(NAACCR)合作,指導(dǎo)所有州的登記機(jī)構(gòu)獲得可接受的數(shù)據(jù)內(nèi)容和兼容性,以匯集數(shù)據(jù)并改善國(guó)家估算。SEER團(tuán)隊(duì)正在開(kāi)發(fā)計(jì)算機(jī)應(yīng)用程序,以統(tǒng)一癌癥注冊(cè)系統(tǒng)并分析和傳播基于人群的數(shù)據(jù)。通過(guò)基于Web的數(shù)據(jù)訪問(wèn)和分析工具以及與其他國(guó)家數(shù)據(jù)源的鏈接,正在改進(jìn)將監(jiān)視數(shù)據(jù)用于研究的用途。例如,面向公共衛(wèi)生官員和決策者的基于Web的工具State Cancer Profiles提供了一個(gè)用戶友好的界面,可用于查找特定州和縣的癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。該網(wǎng)站是NCI和CDC之間的一個(gè)聯(lián)合項(xiàng)目,是該網(wǎng)站的一部分外部網(wǎng)站政策癌癥控制PLANET網(wǎng)站提供了指向公共衛(wèi)生專(zhuān)業(yè)人員的綜合癌癥控制資源的鏈接。SEER員工還與許多參與癌癥監(jiān)測(cè)及相關(guān)學(xué)科的合作組織合作。

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