航海部門在編制序列上是航母的第一部門，代號(hào)是01。這也是海軍的傳統(tǒng)，航海部門在各種類型的艦艇編制序列中，都是第一部門。也是由于我國海軍建軍時(shí)間短，在相當(dāng)長的一段時(shí)間里，能夠在錯(cuò)綜復(fù)雜的海況下安全平穩(wěn)的操縱艦船是海軍的第一要求，航海部門出生的干部也有更多的機(jī)會(huì)升任艦長。最近一些年，隨著海軍發(fā)展，航海技術(shù)的進(jìn)度，艦艇操作技術(shù)從一種高級(jí)專業(yè)化的技術(shù)，轉(zhuǎn)換為海軍中高級(jí)軍官必備的基本技能，航海部門的地位逐步下降，更偏向作戰(zhàn)的作戰(zhàn)部門地位上升。航海部門出生的干部，升任艦長的比列也在大幅度下降。

回到航母來講，航母最重要的功能就是保障艦載機(jī)起降，所以相對(duì)比較重要的部門自然是航空部門。機(jī)電部門因?yàn)檎瓶刂膭?dòng)力系統(tǒng)，包括消防和損害管制，所以機(jī)電部門也很重要。這兩個(gè)部門也是編制人數(shù)最多的部門。航海部門雖然編制序列保持海軍的傳統(tǒng)，排在8部門之首，重要性卻并沒有特別高。

航海部門為正團(tuán)級(jí)單位，下屬兩個(gè)正營級(jí)單位。一個(gè)是負(fù)責(zé)艦艇操作的導(dǎo)航中隊(duì)，一個(gè)是負(fù)責(zé)氣象水文業(yè)務(wù)保障的氣象水溫中心。級(jí)別雖然是團(tuán)級(jí)單位，整個(gè)部門的人員編制也就100來人，其實(shí)就是一個(gè)連的水平，日常業(yè)務(wù)操作也和連級(jí)單位差不多。部門設(shè)部門長1人，副部門長編制2人。但實(shí)際上最多時(shí)有4人，出于儲(chǔ)備干部的考慮，初期航母部隊(duì)大規(guī)模的接受各單位干部，大規(guī)模接受軍校和國防生畢業(yè)學(xué)員，導(dǎo)致所有崗位干部堆積扎堆，一個(gè)編制對(duì)應(yīng)著3-4人的情況也不少見。

導(dǎo)航中隊(duì)設(shè)中對(duì)長1人，副中隊(duì)長視情況而定。下轄航行分隊(duì)和慣導(dǎo)分隊(duì)（后改為慣導(dǎo)區(qū)隊(duì)）。中隊(duì)長正營級(jí)，一般為少校，優(yōu)秀的也可以時(shí)上尉。

航行分隊(duì)設(shè)分隊(duì)長一名，工程師軍官3-4名。這些就是在艦艇駕駛室的海圖室繪制海圖，制作航行計(jì)劃的軍官。

航行分隊(duì)下設(shè)3個(gè)班，分別是操舵班，大海航行靠舵手的舵手就是這個(gè)班的工作；導(dǎo)航雷達(dá)班，負(fù)責(zé)導(dǎo)航雷達(dá)操作與維護(hù)；電航班，負(fù)責(zé)電子導(dǎo)航儀器，包括深度計(jì)。

慣導(dǎo)分隊(duì)（區(qū)隊(duì)）（為分隊(duì)則分隊(duì)長為軍官，為區(qū)隊(duì)則區(qū)隊(duì)長為軍士長）設(shè)有三個(gè)班，依次為慣導(dǎo)一班、二班、三班。負(fù)責(zé)慣性導(dǎo)航，為艦載機(jī)提供慣性導(dǎo)航參數(shù)信息。

氣象水文中心設(shè)氣象保障室、水文保障室和觀察班。氣象水文中心設(shè)主任一名，副主任視情而定，氣象保障室和水文保障室全部為技術(shù)軍官，觀察班為戰(zhàn)士。氣象水文中心是純技術(shù)專業(yè)，所有軍官編制多余戰(zhàn)士。