?如果你的摯愛死在面前，如果你所深信的不過是一場(chǎng)騙局，如果你堵上一切換來(lái)的只是無(wú)盡的絕望與悲劇，那么活著究竟是為了什么，《尼爾：機(jī)械紀(jì)元》向我們呈現(xiàn)了這樣一個(gè)故事。

故事發(fā)生在遙遠(yuǎn)的未來(lái)，人類生存的土地已經(jīng)被外星人所研發(fā)的機(jī)械生命占據(jù)，為了有朝一日奪回地球，人類在月球的反抗軍制造了人造人軍團(tuán)寄葉部隊(duì)。在一周目的結(jié)尾，2B和9S殺掉了機(jī)械生命進(jìn)化的頂點(diǎn)—亞當(dāng)，之后寄葉部隊(duì)準(zhǔn)備組織大規(guī)模的反攻行動(dòng)，根除機(jī)械生命體，這一切看起來(lái)似乎都是充滿希望的。然而，9S在機(jī)體調(diào)整的時(shí)候發(fā)現(xiàn)寄葉部隊(duì)的服務(wù)器有異常，于是沒有同步數(shù)據(jù)，由此也逃過了一劫，也發(fā)現(xiàn)了一個(gè)驚天秘密，月球上的人類，根本不存在，人類早就滅亡了......

在肅清計(jì)劃的執(zhí)行過程中，突然周圍寄葉部隊(duì)的隊(duì)友變得很奇怪，開始攻擊隊(duì)友，9S救出2B趕回司令部報(bào)告這一危急的情況，但一切都已經(jīng)晚了，病毒早已擴(kuò)散到了所有的寄葉機(jī)體，原來(lái)一切都是騙局，人類在寄葉部隊(duì)的系統(tǒng)中留下了后門，在機(jī)械生命被消滅后，抹除寄葉部隊(duì)，讓一切真相記載消失，讓人類還在月球這一騙局成為真實(shí)。

也許故事到了這里就結(jié)束了，這個(gè)故事就是一個(gè)很常見的悲劇劇本，但故事到這里遠(yuǎn)沒有結(jié)束，整個(gè)故事在之后的情節(jié)里真正的升華。