將DICOM數(shù)據(jù)轉換成NIFTI格式，是醫(yī)學圖像處理中的一個基本需求。多款軟件可以實現(xiàn)，應用比較多的是mricron中的dcm2niix.exe工具。但是該工具不易于數(shù)據(jù)的批量轉換。本文提出了一種Matlab + mricron批量轉換的思路，供大家參考。

1. 前期準備

• 安裝matlab。
• 下載mricron，解壓縮。https://www.nitrc.org/frs/?group_id=152
• 下載spm12, 解壓縮后，添加到matlab的環(huán)境變量中。https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/download/

2. mricron添加到環(huán)境變量中

• 從控制面板，系統(tǒng)，找到下圖所示的高級系統(tǒng)設置，點擊進入。
  

  環(huán)境變量1.png

• 點擊環(huán)境變量。

  
  
  環(huán)境變量2.png

• 在環(huán)境變量里面，選中Path, 點擊編輯

環(huán)境變量3.png

• 選擇New,輸入mricron文件夾的位置，保存退出。

環(huán)境變量4.png

• 驗證環(huán)境變量是否設置成功。同時按下windows + R鍵，輸入cmd,打開下面的界面，輸入dcm2niix，回車，如果出現(xiàn)下面的內(nèi)容，說明環(huán)境變量設置正確。

dcm2nii.png

3. Matlab使用

在matlab中，復制下面的代碼到命令行中，回車運行， 選擇要處理的數(shù)據(jù)文件夾，即可批量轉換。

dirNames = cellstr(spm_select(Inf, 'dir'));

for i_a = 1:numel(dirNames)
   dirName = dirNames{i_a};
   cd(dirName);
   fList = dir('*');
   fList(1:2) = [];
   
   if isempty(fList)
      disp(dirName) 
   end
   
   cmdline = sprintf('dcm2niix -g N %s', fList(1).name);
   system(cmdline)
end