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這里需要輸入兩個樣本名字,其實這兩個$T and $N 的名字是限定死的,不可以亂取

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例如這里雖然文件名使用了sample20170711-4_I6_S6_L007,但是其實實際上正確的$N 應(yīng)該是sample20170711-4_I6_S6_L007_R1。否則會出現(xiàn)類似的報錯

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A USER ERROR has occurred: Bad input: Sample sample20170711-4_I6_S6_L007 is not in BAM header: [Msample20190927-1-I44_L4_D95T59, sample20170711-4_I6_S6_L007_R1]

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這樣才可以正常運行